20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0113 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0113  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  702    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2697  hypothetical protein  33.62 
 
 
378 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.644879 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1386  hypothetical protein  28.62 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2539  hypothetical protein  31.22 
 
 
332 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.10034 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0114  hypothetical protein  28.57 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2517  hypothetical protein  22.22 
 
 
313 aa  60.1  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.770252  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3881  hypothetical protein  23.47 
 
 
448 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2913  hypothetical protein  24.77 
 
 
312 aa  56.6  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.410648  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1499  hypothetical protein  23.5 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.488999  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5074  hypothetical protein  26.4 
 
 
383 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  34.65 
 
 
376 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  34.65 
 
 
376 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  34.65 
 
 
376 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  31.18 
 
 
392 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.68 
 
 
393 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.68 
 
 
393 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1959  hypothetical protein  24.3 
 
 
336 aa  47.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  32.97 
 
 
378 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.16 
 
 
436 aa  43.1  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0345  hypothetical protein  25 
 
 
338 aa  43.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.301298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>