18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1386 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1386  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  815    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3881  hypothetical protein  27.97 
 
 		 448 aa  72  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2539  hypothetical protein  29.19 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10034 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0114  hypothetical protein  27.83 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0113  hypothetical protein  27.72 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2697  hypothetical protein  25 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.644879 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1499  hypothetical protein  27.6 
 
 		 310 aa  59.7  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.488999  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2517  hypothetical protein  25.42 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.770252  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5867  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  28.11 
 
 		 434 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325984  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5371  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  30.11 
 
 		 398 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2913  hypothetical protein  22.13 
 
 		 312 aa  50.1  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.410648  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2669  hypothetical protein  31.58 
 
 		 326 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40549  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.85 
 
 		 376 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3126  hypothetical protein  36.36 
 
 		 358 aa  46.6  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.764656  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2017  hypothetical protein  25.53 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.0726848 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.85 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.67 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.07 
 
 		 376 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>