50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4388 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4388  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  759    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315553  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1718  hypothetical protein  68.15 
 
 		 388 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3755  hypothetical protein  64.1 
 
 		 385 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1273  hypothetical protein  55.46 
 
 		 406 aa  365  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.202328  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1521  hypothetical protein  55.24 
 
 		 407 aa  360  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5467  hypothetical protein  56.3 
 
 		 411 aa  355  5e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0252  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase  40.56 
 
 		 396 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64776  normal  0.788486 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3019  hypothetical protein  32.42 
 
 		 426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.104739  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3984  hypothetical protein  33.33 
 
 		 427 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  30 
 
 		 430 aa  125  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1873  hypothetical protein  30.7 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1947  hypothetical protein  30.42 
 
 		 428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.923183  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1019  hypothetical protein  30.14 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.495508  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2521  hypothetical protein  32.99 
 
 		 424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3833  hypothetical protein  29.81 
 
 		 425 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.17 
 
 		 436 aa  106  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3542  hypothetical protein  29.25 
 
 		 425 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1066  hypothetical protein  30.28 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0710  cellulose biosynthesis protein CelD  30.09 
 
 		 436 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  0.329061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0723  cellulose biosynthesis protein CelD  30.09 
 
 		 451 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1918  hypothetical protein  31.93 
 
 		 394 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.618119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  33.02 
 
 		 379 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1843  hypothetical protein  26.44 
 
 		 425 aa  90.5  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  30 
 
 		 374 aa  89.7  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3070  cellulose biosynthesis protein CelD  31.03 
 
 		 386 aa  83.2  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  27.78 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1179  cellulose biosynthesis protein CelD  28.57 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.60809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6618  cellulose biosynthesis protein CelD  26.22 
 
 		 437 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.674224  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  27.84 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2372  hypothetical protein  29.53 
 
 		 379 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000887607 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1867  hypothetical protein  24.31 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  31.58 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5326  hypothetical protein  31.58 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  0.0831536 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.47 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1961  hypothetical protein  31.2 
 
 		 363 aa  57  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4625  hypothetical protein  31.52 
 
 		 413 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  33.71 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  35.51 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0925  hypothetical protein  30.52 
 
 		 385 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.64 
 
 		 368 aa  50.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2373  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.09 
 
 		 381 aa  50.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  25.32 
 
 		 370 aa  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  33.61 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3993  Tetratricopeptide domain protein  26.52 
 
 		 550 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0949  hypothetical protein  28.42 
 
 		 380 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  27.03 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  32.2 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4322  Tetratricopeptide domain protein  28.68 
 
 		 550 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576139 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0986  hypothetical protein  27.37 
 
 		 380 aa  43.1  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.366452 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0964  TPR and WD-40 repeat-containing protein  28.32 
 
 		 506 aa  42.7  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.907164 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>