45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1867 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1867  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  803    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1179  cellulose biosynthesis protein CelD  29.84 
 
 		 411 aa  158  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.60809 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1843  hypothetical protein  29.89 
 
 		 425 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0723  cellulose biosynthesis protein CelD  27.93 
 
 		 451 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0710  cellulose biosynthesis protein CelD  27.93 
 
 		 436 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  0.329061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  28.32 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1521  hypothetical protein  25.34 
 
 		 407 aa  84  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1918  hypothetical protein  26.61 
 
 		 394 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.618119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5467  hypothetical protein  26.28 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1273  hypothetical protein  25.14 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.202328  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3984  hypothetical protein  24.38 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.75 
 
 		 436 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1873  hypothetical protein  24.93 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1947  hypothetical protein  24.65 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.923183  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1019  hypothetical protein  23.84 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.495508  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  24.92 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  25.74 
 
 		 430 aa  72  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3542  hypothetical protein  25.35 
 
 		 425 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1718  hypothetical protein  25.42 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  25.23 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3833  hypothetical protein  24.79 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3019  hypothetical protein  24.26 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.104739  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0949  hypothetical protein  30.04 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  25.64 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3755  hypothetical protein  24.69 
 
 		 385 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3070  cellulose biosynthesis protein CelD  28.02 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2372  hypothetical protein  26.63 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000887607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0986  hypothetical protein  30.04 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.366452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0925  hypothetical protein  35.38 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4388  hypothetical protein  24 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315553  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2521  hypothetical protein  27.45 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.06 
 
 		 359 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  31.13 
 
 		 391 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1066  hypothetical protein  23.93 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1961  hypothetical protein  30.58 
 
 		 363 aa  54.3  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5326  hypothetical protein  28.98 
 
 		 382 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  0.0831536 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.51 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0252  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase  24.62 
 
 		 396 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64776  normal  0.788486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6618  cellulose biosynthesis protein CelD  28 
 
 		 437 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.674224  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.98 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.13 
 
 		 376 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.13 
 
 		 376 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  22.98 
 
 		 401 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.59 
 
 		 393 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.59 
 
 		 393 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>