43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0961 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0961  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
358 aa  689    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  73.11 
 
 
355 aa  454  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2696  glycosyl transferase, group 1  37.26 
 
 
311 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1016  glycosyl transferase, group 1  39.81 
 
 
689 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1074  glycosyl transferase group 1  39.27 
 
 
690 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1077  glycosyl transferase group 1  39.14 
 
 
690 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.383593  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2360  cellulose biosynthesis protein CelD  27.81 
 
 
382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.57 
 
 
401 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  34.08 
 
 
393 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  34.08 
 
 
393 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5827  cellulose biosynthesis protein CelD  28.2 
 
 
397 aa  93.6  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.297647  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  34.44 
 
 
392 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.91 
 
 
368 aa  83.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1950  hypothetical protein  32.38 
 
 
390 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0965898  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0891  hypothetical protein  24.41 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3071  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.63 
 
 
393 aa  72.8  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1797  hypothetical protein  31.11 
 
 
389 aa  66.6  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_875  hypothetical protein  23.99 
 
 
329 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1556  cellulose biosynthesis protein CelD  34.27 
 
 
378 aa  60.8  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0964  TPR and WD-40 repeat-containing protein  25.07 
 
 
506 aa  60.5  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.907164 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1959  hypothetical protein  31.09 
 
 
336 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0855  hypothetical protein  25.56 
 
 
416 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  0.24212 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3884  hypothetical protein  29.24 
 
 
420 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1003  hypothetical protein  24.41 
 
 
325 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.305983  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  23.81 
 
 
370 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1625  hypothetical protein  26.15 
 
 
373 aa  53.9  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.370324  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0159  hypothetical protein  22.93 
 
 
370 aa  53.5  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3792  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)  26.98 
 
 
331 aa  52.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4604  hypothetical protein  26.79 
 
 
406 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2685  hypothetical protein  25.39 
 
 
399 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527922  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.58 
 
 
359 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1801  cellulose biosynthesis protein CelD  31.69 
 
 
376 aa  50.8  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3092  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  27.81 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0510959  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2698  hypothetical protein  25.42 
 
 
400 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.402222  normal  0.567569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  29.7 
 
 
374 aa  47  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1314  hypothetical protein  24.85 
 
 
413 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1416  hypothetical protein  23.3 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5313  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.33 
 
 
386 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323377  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1783  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  23.65 
 
 
376 aa  43.9  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.594262  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3221  hypothetical protein  23.89 
 
 
395 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.978135  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2662  hypothetical protein  25.44 
 
 
400 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.752873  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4322  Tetratricopeptide domain protein  33.33 
 
 
550 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.576139 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3993  Tetratricopeptide domain protein  33.33 
 
 
550 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>