33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1801 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1801  cellulose biosynthesis protein CelD  100 
 
 
376 aa  752    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3071  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  33.61 
 
 
393 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1556  cellulose biosynthesis protein CelD  36.82 
 
 
378 aa  129  8.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0159  hypothetical protein  28.33 
 
 
370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5827  cellulose biosynthesis protein CelD  35.14 
 
 
397 aa  96.3  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.297647  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3884  hypothetical protein  26.96 
 
 
420 aa  90.5  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1200  hypothetical protein  26.36 
 
 
378 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01309  hypothetical protein  30.64 
 
 
368 aa  80.1  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.127385  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  34.19 
 
 
355 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2360  cellulose biosynthesis protein CelD  26.32 
 
 
382 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5588  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.02 
 
 
379 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0964  TPR and WD-40 repeat-containing protein  30 
 
 
506 aa  62  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.907164 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0432  cellulose biosynthesis protein CelD  19.77 
 
 
374 aa  60.5  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.98 
 
 
392 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  31.35 
 
 
393 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  31.35 
 
 
393 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0710  cellulose biosynthesis protein CelD  24.48 
 
 
436 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  0.329061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0723  cellulose biosynthesis protein CelD  24.48 
 
 
451 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186832  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1003  hypothetical protein  25.17 
 
 
325 aa  54.3  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.305983  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_875  hypothetical protein  24.84 
 
 
329 aa  54.3  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0891  hypothetical protein  24.84 
 
 
329 aa  53.5  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4322  Tetratricopeptide domain protein  26.88 
 
 
550 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.576139 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.95 
 
 
401 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3993  Tetratricopeptide domain protein  25.93 
 
 
550 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.77 
 
 
359 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0961  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 
358 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2749  hypothetical protein  25.54 
 
 
380 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.49 
 
 
436 aa  47  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1019  hypothetical protein  26.2 
 
 
428 aa  47  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.495508  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3148  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.39 
 
 
377 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0672  hypothetical protein  21.91 
 
 
408 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3792  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)  29.29 
 
 
331 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3070  cellulose biosynthesis protein CelD  28.05 
 
 
386 aa  44.3  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>