36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1950 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1950  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  752    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0965898  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  34.02 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2696  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 		 311 aa  97.1  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2464  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  29.15 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0961  glycosyl transferase, group 1  31.56 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  32.13 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1077  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 		 690 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.383593  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5827  cellulose biosynthesis protein CelD  26.16 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.297647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.67 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1074  glycosyl transferase group 1  33.66 
 
 		 690 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1016  glycosyl transferase, group 1  33.01 
 
 		 689 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3221  hypothetical protein  24.65 
 
 		 395 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.978135  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5314  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 		 389 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1959  hypothetical protein  26.79 
 
 		 336 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3071  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.62 
 
 		 393 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.56 
 
 		 393 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.28 
 
 		 393 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3884  hypothetical protein  28.12 
 
 		 420 aa  49.7  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.87 
 
 		 378 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1003  hypothetical protein  22.67 
 
 		 325 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.305983  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2686  GCN5-related N-acetyltransferase  34.03 
 
 		 567 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0893187  normal  0.171928 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0159  hypothetical protein  21.92 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.79 
 
 		 376 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0432  cellulose biosynthesis protein CelD  18.9 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.79 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0133  protein of unknown function DUF482  28.02 
 
 		 403 aa  47.4  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00342506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01036  hypothetical protein  28.9 
 
 		 388 aa  47  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479769  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06130  hypothetical protein  28.9 
 
 		 388 aa  47  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.187585  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3993  Tetratricopeptide domain protein  21.59 
 
 		 550 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1930  protein of unknown function DUF482  30.59 
 
 		 374 aa  44.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.207995 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0964  TPR and WD-40 repeat-containing protein  23.74 
 
 		 506 aa  44.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.907164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1577  protein of unknown function DUF482  24.26 
 
 		 396 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.187748 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1187  hypothetical protein  24.75 
 
 		 391 aa  43.5  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.225085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2360  cellulose biosynthesis protein CelD  33.33 
 
 		 382 aa  43.1  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2282  hypothetical protein  40.28 
 
 		 406 aa  43.1  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1783  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  26.98 
 
 		 376 aa  42.7  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.594262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>