155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1187 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1187  hypothetical protein  100 
 
 
391 aa  816    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.225085  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0804  hypothetical protein  64.29 
 
 
391 aa  532  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4569  hypothetical protein  61.7 
 
 
403 aa  516  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1577  protein of unknown function DUF482  59.64 
 
 
396 aa  511  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.187748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0543  protein of unknown function DUF482  59.24 
 
 
395 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0560  protein of unknown function DUF482  59.24 
 
 
395 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3564  protein of unknown function DUF482  58.79 
 
 
391 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.221346 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2342  hypothetical protein  57.11 
 
 
391 aa  453  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0350  hypothetical protein  53.83 
 
 
391 aa  434  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02101  hypothetical protein  55.41 
 
 
378 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01201  hypothetical protein  50.53 
 
 
390 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.640897  normal  0.481871 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1473  hypothetical protein  48.84 
 
 
393 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01761  hypothetical protein  48.59 
 
 
393 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.46624  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0108  hypothetical protein  45.82 
 
 
384 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.139955  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01211  hypothetical protein  45.28 
 
 
384 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01201  hypothetical protein  44.27 
 
 
384 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01171  hypothetical protein  45.01 
 
 
388 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.173885  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0133  protein of unknown function DUF482  45.1 
 
 
403 aa  359  5e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00342506  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0437  hypothetical protein  34.55 
 
 
387 aa  226  4e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2555  hypothetical protein  36.15 
 
 
414 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0252  hypothetical protein  35.79 
 
 
393 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0896  hypothetical protein  36.15 
 
 
414 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3103  hypothetical protein  35.29 
 
 
376 aa  221  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.73421  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2786  hypothetical protein  35.29 
 
 
381 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0822  hypothetical protein  31.12 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.295229  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3017  hypothetical protein  32.79 
 
 
384 aa  220  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1294  hypothetical protein  35.03 
 
 
393 aa  218  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.724983  normal  0.811045 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0135  protein of unknown function DUF482  33.51 
 
 
406 aa  218  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2475  hypothetical protein  33.25 
 
 
395 aa  218  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.407377  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1444  protein of unknown function DUF482  34.53 
 
 
411 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2007  protein of unknown function DUF482  32.9 
 
 
392 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2969  hypothetical protein  35.77 
 
 
381 aa  216  5.9999999999999996e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4092  hypothetical protein  35.01 
 
 
375 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3005  hypothetical protein  36.41 
 
 
383 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4753  hypothetical protein  33.58 
 
 
402 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.51971 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4685  protein of unknown function DUF482  36.06 
 
 
406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3312  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2734  hypothetical protein  36.91 
 
 
385 aa  214  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1114  protein of unknown function DUF482  33.25 
 
 
392 aa  213  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.333144 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0908  hypothetical protein  36.06 
 
 
373 aa  213  7e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562681  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4316  hypothetical protein  36.06 
 
 
406 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3828  hypothetical protein  34.38 
 
 
375 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210412  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19080  hypothetical protein  36.15 
 
 
374 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0745  protein of unknown function DUF482  33.9 
 
 
413 aa  209  5e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00828305 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1425  hypothetical protein  35.42 
 
 
374 aa  209  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.345024 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4050  hypothetical protein  34.57 
 
 
375 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2323  hypothetical protein  36.08 
 
 
392 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.471895  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5740  hypothetical protein  35.82 
 
 
392 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3841  hypothetical protein  33.67 
 
 
416 aa  207  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.614644  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1347  hypothetical protein  34.31 
 
 
394 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2417  hypothetical protein  35.82 
 
 
392 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.673667  normal  0.0190965 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3142  hypothetical protein  36.15 
 
 
386 aa  206  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0531471 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1249  hypothetical protein  34.83 
 
 
374 aa  206  7e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4833  protein of unknown function DUF482  34.93 
 
 
406 aa  206  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261808  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3837  hypothetical protein  33.95 
 
 
375 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal  0.855927 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2458  hypothetical protein  35.75 
 
 
374 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1665  hypothetical protein  32.68 
 
 
418 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.750799  normal  0.0965206 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0804  hypothetical protein  34.47 
 
 
402 aa  204  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2322  hypothetical protein  32.83 
 
 
427 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.483949 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2114  hypothetical protein  35.28 
 
 
391 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0393548 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4593  hypothetical protein  32.32 
 
 
405 aa  204  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3315  hypothetical protein  32.87 
 
 
406 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.479503  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1801  hypothetical protein  34.63 
 
 
392 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2413  hypothetical protein  34.63 
 
 
392 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2348  hypothetical protein  35.29 
 
 
408 aa  203  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291454  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3397  hypothetical protein  35.19 
 
 
389 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6252  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4543  hypothetical protein  33.78 
 
 
403 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3548  protein of unknown function DUF482  34.47 
 
 
409 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1116  protein of unknown function DUF482  35.19 
 
 
389 aa  202  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.492606  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2406  hypothetical protein  33.8 
 
 
411 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.688762  normal  0.186145 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3481  hypothetical protein  36.26 
 
 
388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.334127 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1140  hypothetical protein  31.01 
 
 
394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2157  hypothetical protein  32.86 
 
 
455 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.391826  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0877  hypothetical protein  34.79 
 
 
392 aa  199  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0166  protein of unknown function DUF482  31.47 
 
 
405 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0717665  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22410  hypothetical protein  34.7 
 
 
374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000252116 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1736  hypothetical protein  33.17 
 
 
414 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.327747 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0679  hypothetical protein  31.35 
 
 
374 aa  198  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.323848  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2563  protein of unknown function DUF482  35.17 
 
 
410 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.871216  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0943  hypothetical protein  37.6 
 
 
380 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118065  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1760  hypothetical protein  35.01 
 
 
406 aa  197  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0063  hypothetical protein  32.74 
 
 
386 aa  197  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405281  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3045  hypothetical protein  33.71 
 
 
411 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1962  protein of unknown function DUF482  34.84 
 
 
456 aa  196  6e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.846465  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2871  hypothetical protein  33.86 
 
 
388 aa  196  6e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2611  hypothetical protein  34.96 
 
 
415 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1425  hypothetical protein  28.33 
 
 
414 aa  195  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.625932  normal  0.472174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2458  hypothetical protein  33.8 
 
 
423 aa  195  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2450  hypothetical protein  28.02 
 
 
417 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.456626  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01036  hypothetical protein  35.25 
 
 
388 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479769  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06130  hypothetical protein  35.25 
 
 
388 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.187585  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3121  hypothetical protein  33.67 
 
 
438 aa  194  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2105  hypothetical protein  32.81 
 
 
438 aa  193  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2359  protein of unknown function DUF482  33.51 
 
 
393 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.597494  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3419  hypothetical protein  34.7 
 
 
388 aa  193  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.346607  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3568  protein of unknown function DUF482  34.14 
 
 
388 aa  193  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.207559  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1930  hypothetical protein  30.71 
 
 
405 aa  193  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0856188 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0679  hypothetical protein  35.55 
 
 
400 aa  192  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3500  protein of unknown function DUF482  34.14 
 
 
388 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2025  hypothetical protein  31.33 
 
 
405 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2534  hypothetical protein  31.79 
 
 
384 aa  191  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>