157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3017 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3017  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  812    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0063  hypothetical protein  46.6 
 
 		 386 aa  350  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02848  hypothetical protein  43.41 
 
 		 445 aa  350  3e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.29586  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0679  hypothetical protein  41.58 
 
 		 374 aa  333  3e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.323848  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1930  hypothetical protein  41.1 
 
 		 405 aa  331  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0856188 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1865  hypothetical protein  42.89 
 
 		 406 aa  331  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.164344  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3841  hypothetical protein  42.82 
 
 		 416 aa  329  4e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.614644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2329  hypothetical protein  41.6 
 
 		 392 aa  325  7e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653635  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0822  hypothetical protein  41.93 
 
 		 390 aa  325  1e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.295229  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1656  hypothetical protein  39.68 
 
 		 433 aa  323  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1708  hypothetical protein  40.65 
 
 		 418 aa  319  6e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5740  hypothetical protein  43.46 
 
 		 392 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2273  hypothetical protein  42.86 
 
 		 392 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1116  protein of unknown function DUF482  43.44 
 
 		 389 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.492606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3011  hypothetical protein  42.86 
 
 		 392 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1586  hypothetical protein  42.86 
 
 		 392 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215515  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2157  hypothetical protein  38.48 
 
 		 455 aa  317  2e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.391826  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0740  hypothetical protein  42.86 
 
 		 441 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.391728  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1241  hypothetical protein  42.86 
 
 		 464 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3397  hypothetical protein  42.93 
 
 		 389 aa  316  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1083  hypothetical protein  42.86 
 
 		 441 aa  316  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1088  hypothetical protein  42.86 
 
 		 441 aa  316  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267189  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2348  hypothetical protein  42.27 
 
 		 408 aa  316  4e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291454  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2417  hypothetical protein  42.93 
 
 		 392 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.673667  normal  0.0190965 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2170  hypothetical protein  42.67 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164145  hitchhiker  0.00000155889 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1801  hypothetical protein  42.41 
 
 		 392 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2413  hypothetical protein  42.41 
 
 		 392 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0877  hypothetical protein  42.34 
 
 		 392 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2323  hypothetical protein  42.67 
 
 		 392 aa  311  9e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.471895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2114  hypothetical protein  43.16 
 
 		 391 aa  311  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0393548 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2871  hypothetical protein  42.05 
 
 		 388 aa  308  9e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0657  hypothetical protein  40.96 
 
 		 373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2611  hypothetical protein  44.13 
 
 		 415 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2458  hypothetical protein  42.67 
 
 		 374 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2486  hypothetical protein  39.9 
 
 		 421 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.954327  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2563  protein of unknown function DUF482  41.82 
 
 		 410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.871216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0881  hypothetical protein  41.97 
 
 		 410 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642732  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2359  protein of unknown function DUF482  40.31 
 
 		 393 aa  303  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.597494  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2159  protein of unknown function DUF482  41.13 
 
 		 410 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.296465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1736  hypothetical protein  40.15 
 
 		 414 aa  302  6.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.327747 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0679  hypothetical protein  40.86 
 
 		 400 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2296  hypothetical protein  38.95 
 
 		 421 aa  300  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.124232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3828  hypothetical protein  39.47 
 
 		 375 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210412  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0804  hypothetical protein  40.92 
 
 		 402 aa  297  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2534  hypothetical protein  39.05 
 
 		 384 aa  297  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22410  hypothetical protein  40.75 
 
 		 374 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000252116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4876  hypothetical protein  38.06 
 
 		 407 aa  296  4e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239884  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4092  hypothetical protein  39.52 
 
 		 375 aa  295  8e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19080  hypothetical protein  39.57 
 
 		 374 aa  294  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2734  hypothetical protein  39.08 
 
 		 385 aa  292  6e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3315  hypothetical protein  40.06 
 
 		 406 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.479503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1758  protein of unknown function DUF482  39.51 
 
 		 426 aa  290  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2969  hypothetical protein  40.32 
 
 		 381 aa  289  7e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4050  hypothetical protein  38.44 
 
 		 375 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2475  hypothetical protein  39.9 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.407377  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0114  hypothetical protein  37.83 
 
 		 421 aa  288  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139598  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1953  hypothetical protein  38.83 
 
 		 432 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2322  hypothetical protein  38.12 
 
 		 427 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.483949 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1896  hypothetical protein  40.61 
 
 		 374 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2368  hypothetical protein  39.8 
 
 		 398 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0181768  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1140  hypothetical protein  35.6 
 
 		 394 aa  285  8e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3121  hypothetical protein  38.3 
 
 		 438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3837  hypothetical protein  38.17 
 
 		 375 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal  0.855927 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1249  hypothetical protein  39.41 
 
 		 374 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25813 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1425  hypothetical protein  40.17 
 
 		 414 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.625932  normal  0.472174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1347  hypothetical protein  37.63 
 
 		 394 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1728  protein of unknown function DUF482  35.47 
 
 		 470 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0347307  normal  0.0114903 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1668  hypothetical protein  37.5 
 
 		 427 aa  280  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2802  hypothetical protein  38.95 
 
 		 398 aa  280  3e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0294833  normal  0.670826 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4543  hypothetical protein  37.37 
 
 		 403 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1760  hypothetical protein  38.97 
 
 		 406 aa  279  6e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1425  hypothetical protein  37.63 
 
 		 374 aa  278  9e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345024 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2619  hypothetical protein  35.47 
 
 		 470 aa  278  9e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1962  protein of unknown function DUF482  38.97 
 
 		 456 aa  278  9e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.846465  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0943  hypothetical protein  41.29 
 
 		 380 aa  278  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118065  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2450  hypothetical protein  39 
 
 		 417 aa  278  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.456626  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2732  hypothetical protein  35.26 
 
 		 470 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.96402  normal  0.438738 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1294  hypothetical protein  38.83 
 
 		 393 aa  276  4e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.724983  normal  0.811045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3791  hypothetical protein  38.79 
 
 		 390 aa  276  4e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2657  hypothetical protein  34.83 
 
 		 470 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00609498  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2406  hypothetical protein  37.3 
 
 		 411 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.688762  normal  0.186145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3045  hypothetical protein  38.98 
 
 		 411 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4593  hypothetical protein  37.53 
 
 		 405 aa  275  9e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2308  hypothetical protein  36.32 
 
 		 451 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0870816  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3548  protein of unknown function DUF482  38.07 
 
 		 409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0166  protein of unknown function DUF482  39.2 
 
 		 405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0717665  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0437  hypothetical protein  37.23 
 
 		 387 aa  273  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1715  hypothetical protein  38.83 
 
 		 377 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0135  protein of unknown function DUF482  36.79 
 
 		 406 aa  272  6e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2458  hypothetical protein  36.75 
 
 		 423 aa  272  7e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1114  protein of unknown function DUF482  37.89 
 
 		 392 aa  270  4e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.333144 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0745  protein of unknown function DUF482  35.9 
 
 		 413 aa  269  7e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00828305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4316  hypothetical protein  35.22 
 
 		 406 aa  267  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1930  protein of unknown function DUF482  37.6 
 
 		 374 aa  267  2.9999999999999995e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.207995 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2105  hypothetical protein  38.27 
 
 		 438 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1377  hypothetical protein  35.6 
 
 		 397 aa  266  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2786  hypothetical protein  38.65 
 
 		 381 aa  265  7e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4685  protein of unknown function DUF482  35.22 
 
 		 406 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3103  hypothetical protein  37.3 
 
 		 376 aa  265  1e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.73421  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4753  hypothetical protein  35.13 
 
 		 402 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.51971 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>