151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1962 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1962  protein of unknown function DUF482  100 
 
 
456 aa  938    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.846465  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1760  hypothetical protein  99.01 
 
 
406 aa  825    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3121  hypothetical protein  66 
 
 
438 aa  523  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2359  protein of unknown function DUF482  64.05 
 
 
393 aa  521  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.597494  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1708  hypothetical protein  62.09 
 
 
418 aa  501  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4876  hypothetical protein  62.97 
 
 
407 aa  496  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239884  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1736  hypothetical protein  64.74 
 
 
414 aa  486  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.327747 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0114  hypothetical protein  58.88 
 
 
421 aa  473  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139598  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2308  hypothetical protein  54.61 
 
 
451 aa  472  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0870816  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2114  hypothetical protein  58.63 
 
 
391 aa  448  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0393548 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2969  hypothetical protein  59.84 
 
 
381 aa  442  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0679  hypothetical protein  52.61 
 
 
400 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2348  hypothetical protein  54.5 
 
 
408 aa  402  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291454  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2563  protein of unknown function DUF482  55.16 
 
 
410 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.871216  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2159  protein of unknown function DUF482  54.91 
 
 
410 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.296465  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2611  hypothetical protein  51.56 
 
 
415 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2323  hypothetical protein  54.64 
 
 
392 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.471895  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0740  hypothetical protein  52.54 
 
 
441 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.391728  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1241  hypothetical protein  52.79 
 
 
464 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2458  hypothetical protein  54.15 
 
 
374 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2273  hypothetical protein  52.54 
 
 
392 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3011  hypothetical protein  52.54 
 
 
392 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350718  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1083  hypothetical protein  52.79 
 
 
441 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1088  hypothetical protein  52.79 
 
 
441 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267189  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1586  hypothetical protein  52.54 
 
 
392 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215515  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0881  hypothetical protein  53.54 
 
 
410 aa  385  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642732  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3397  hypothetical protein  52.45 
 
 
389 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6252  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0877  hypothetical protein  53.61 
 
 
392 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5740  hypothetical protein  53.61 
 
 
392 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1801  hypothetical protein  52.99 
 
 
392 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2413  hypothetical protein  52.99 
 
 
392 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2417  hypothetical protein  53.35 
 
 
392 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.673667  normal  0.0190965 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2170  hypothetical protein  51.81 
 
 
390 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164145  hitchhiker  0.00000155889 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1116  protein of unknown function DUF482  52.2 
 
 
389 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.492606  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0804  hypothetical protein  48.96 
 
 
402 aa  351  2e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0822  hypothetical protein  43.86 
 
 
390 aa  345  1e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.295229  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1758  protein of unknown function DUF482  50.12 
 
 
426 aa  341  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0657  hypothetical protein  46.39 
 
 
373 aa  335  7e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2534  hypothetical protein  45.06 
 
 
384 aa  335  7.999999999999999e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22410  hypothetical protein  44.47 
 
 
374 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000252116 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1896  hypothetical protein  45.26 
 
 
374 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3837  hypothetical protein  43.97 
 
 
375 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal  0.855927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4543  hypothetical protein  41.05 
 
 
403 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3828  hypothetical protein  42.49 
 
 
375 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210412  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19080  hypothetical protein  45.83 
 
 
374 aa  297  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1347  hypothetical protein  41.55 
 
 
394 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4092  hypothetical protein  41.94 
 
 
375 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1249  hypothetical protein  44.56 
 
 
374 aa  296  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4050  hypothetical protein  42.96 
 
 
375 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2105  hypothetical protein  42.03 
 
 
438 aa  288  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1930  protein of unknown function DUF482  43.3 
 
 
374 aa  288  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.207995 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1425  hypothetical protein  42.78 
 
 
374 aa  286  5e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.345024 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0896  hypothetical protein  41.13 
 
 
414 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1114  protein of unknown function DUF482  41.71 
 
 
392 aa  283  6.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.333144 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2555  hypothetical protein  40.9 
 
 
414 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1930  hypothetical protein  38.55 
 
 
405 aa  281  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0856188 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2475  hypothetical protein  39.85 
 
 
395 aa  280  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.407377  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3017  hypothetical protein  38.97 
 
 
384 aa  278  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0252  hypothetical protein  41.28 
 
 
393 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1865  hypothetical protein  38.39 
 
 
406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.164344  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1444  protein of unknown function DUF482  39.86 
 
 
411 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06130  hypothetical protein  41.3 
 
 
388 aa  273  5.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.187585  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01036  hypothetical protein  41.3 
 
 
388 aa  273  5.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479769  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2734  hypothetical protein  41.77 
 
 
385 aa  272  7e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0437  hypothetical protein  40.82 
 
 
387 aa  272  8.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4685  protein of unknown function DUF482  40.29 
 
 
406 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3312  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0063  hypothetical protein  39.8 
 
 
386 aa  272  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405281  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2802  hypothetical protein  40.4 
 
 
398 aa  271  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0294833  normal  0.670826 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3841  hypothetical protein  36.5 
 
 
416 aa  271  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.614644  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4316  hypothetical protein  40.05 
 
 
406 aa  271  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2007  protein of unknown function DUF482  39.95 
 
 
392 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1140  hypothetical protein  35.45 
 
 
394 aa  269  8.999999999999999e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1665  hypothetical protein  38.9 
 
 
418 aa  268  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.750799  normal  0.0965206 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4593  hypothetical protein  38.81 
 
 
405 aa  264  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2786  hypothetical protein  41.67 
 
 
381 aa  262  8e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0790  hypothetical protein  39.07 
 
 
378 aa  262  1e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4833  protein of unknown function DUF482  40.43 
 
 
406 aa  262  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261808  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0745  protein of unknown function DUF482  42.7 
 
 
413 aa  261  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00828305 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0702  hypothetical protein  38.82 
 
 
378 aa  261  2e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1715  hypothetical protein  40.92 
 
 
377 aa  260  4e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2157  hypothetical protein  37.47 
 
 
455 aa  260  4e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.391826  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1377  hypothetical protein  40.32 
 
 
397 aa  259  8e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3103  hypothetical protein  41.48 
 
 
376 aa  258  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.73421  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1656  hypothetical protein  37.42 
 
 
433 aa  258  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3005  hypothetical protein  43.9 
 
 
383 aa  258  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1294  hypothetical protein  39.69 
 
 
393 aa  258  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.724983  normal  0.811045 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2329  hypothetical protein  36.21 
 
 
392 aa  257  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653635  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0679  hypothetical protein  35.14 
 
 
374 aa  257  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.323848  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2871  hypothetical protein  37.95 
 
 
388 aa  256  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0943  hypothetical protein  41.79 
 
 
380 aa  256  6e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118065  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3548  protein of unknown function DUF482  39.62 
 
 
409 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2322  hypothetical protein  39.47 
 
 
427 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.483949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4753  hypothetical protein  41.02 
 
 
402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.51971 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0135  protein of unknown function DUF482  37.68 
 
 
406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2458  hypothetical protein  39.9 
 
 
423 aa  254  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1121  hypothetical protein  39.52 
 
 
395 aa  254  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3791  hypothetical protein  40.99 
 
 
390 aa  254  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2296  hypothetical protein  38.06 
 
 
421 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.124232  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2486  hypothetical protein  37.59 
 
 
421 aa  249  5e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.954327  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1793  hypothetical protein  39.45 
 
 
382 aa  249  6e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>