151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2323 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0740  hypothetical protein  82.73 
 
 		 441 aa  669    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.391728  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2323  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  804    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.471895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1241  hypothetical protein  82.99 
 
 		 464 aa  670    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5740  hypothetical protein  95.63 
 
 		 392 aa  769    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0881  hypothetical protein  83.25 
 
 		 410 aa  677    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642732  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3397  hypothetical protein  79.9 
 
 		 389 aa  651    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1801  hypothetical protein  95.41 
 
 		 392 aa  775    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2458  hypothetical protein  98.66 
 
 		 374 aa  758    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2413  hypothetical protein  95.41 
 
 		 392 aa  775    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2273  hypothetical protein  82.99 
 
 		 392 aa  671    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0877  hypothetical protein  94.87 
 
 		 392 aa  768    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2417  hypothetical protein  95.92 
 
 		 392 aa  776    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.673667  normal  0.0190965 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3011  hypothetical protein  82.73 
 
 		 392 aa  669    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350718  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1083  hypothetical protein  82.99 
 
 		 441 aa  671    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1088  hypothetical protein  82.99 
 
 		 441 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267189  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1586  hypothetical protein  82.73 
 
 		 392 aa  669    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215515  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1116  protein of unknown function DUF482  79.9 
 
 		 389 aa  651    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.492606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2170  hypothetical protein  82.01 
 
 		 390 aa  671    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164145  hitchhiker  0.00000155889 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0679  hypothetical protein  64.43 
 
 		 400 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2611  hypothetical protein  66.23 
 
 		 415 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2563  protein of unknown function DUF482  64.12 
 
 		 410 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.871216  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2348  hypothetical protein  61.54 
 
 		 408 aa  473  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291454  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2159  protein of unknown function DUF482  63.59 
 
 		 410 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.296465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1708  hypothetical protein  55.26 
 
 		 418 aa  414  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2534  hypothetical protein  53.77 
 
 		 384 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2359  protein of unknown function DUF482  52.17 
 
 		 393 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.597494  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0822  hypothetical protein  51.44 
 
 		 390 aa  399  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.295229  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0114  hypothetical protein  51.7 
 
 		 421 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139598  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3121  hypothetical protein  53.32 
 
 		 438 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2969  hypothetical protein  55.73 
 
 		 381 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2114  hypothetical protein  53.81 
 
 		 391 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0393548 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1760  hypothetical protein  54.64 
 
 		 406 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1962  protein of unknown function DUF482  54.64 
 
 		 456 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.846465  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4876  hypothetical protein  51.62 
 
 		 407 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1736  hypothetical protein  53.05 
 
 		 414 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.327747 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2308  hypothetical protein  47.66 
 
 		 451 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0870816  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0657  hypothetical protein  49.21 
 
 		 373 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0804  hypothetical protein  49.35 
 
 		 402 aa  348  9e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1758  protein of unknown function DUF482  50.13 
 
 		 426 aa  346  4e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1930  hypothetical protein  42.36 
 
 		 405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0856188 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1140  hypothetical protein  40.1 
 
 		 394 aa  324  1e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4685  protein of unknown function DUF482  48.29 
 
 		 406 aa  324  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22410  hypothetical protein  47.49 
 
 		 374 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000252116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4316  hypothetical protein  47.77 
 
 		 406 aa  322  7e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2007  protein of unknown function DUF482  45.22 
 
 		 392 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2734  hypothetical protein  45.79 
 
 		 385 aa  320  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2475  hypothetical protein  44.44 
 
 		 395 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.407377  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1896  hypothetical protein  47.7 
 
 		 374 aa  316  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0745  protein of unknown function DUF482  48.47 
 
 		 413 aa  315  8e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00828305 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19080  hypothetical protein  46.05 
 
 		 374 aa  315  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1249  hypothetical protein  46.83 
 
 		 374 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25813 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1377  hypothetical protein  46.52 
 
 		 397 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1665  hypothetical protein  42.93 
 
 		 418 aa  312  7.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.750799  normal  0.0965206 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3017  hypothetical protein  42.67 
 
 		 384 aa  311  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2871  hypothetical protein  43.34 
 
 		 388 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2458  hypothetical protein  44.79 
 
 		 423 aa  308  8e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4833  protein of unknown function DUF482  47.77 
 
 		 406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261808  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1715  hypothetical protein  44.09 
 
 		 377 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4050  hypothetical protein  44.5 
 
 		 375 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1167  hypothetical protein  44.47 
 
 		 395 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0877771  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1124  hypothetical protein  44.47 
 
 		 395 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.326303  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4593  hypothetical protein  43.62 
 
 		 405 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3791  hypothetical protein  44.76 
 
 		 390 aa  302  8.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4092  hypothetical protein  43.39 
 
 		 375 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1425  hypothetical protein  43.01 
 
 		 374 aa  300  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345024 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3315  hypothetical protein  45.43 
 
 		 406 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.479503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3548  protein of unknown function DUF482  44.41 
 
 		 409 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2025  hypothetical protein  42.97 
 
 		 405 aa  301  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2406  hypothetical protein  43.8 
 
 		 411 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.688762  normal  0.186145 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2555  hypothetical protein  44.76 
 
 		 414 aa  299  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0896  hypothetical protein  45.03 
 
 		 414 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1347  hypothetical protein  44.12 
 
 		 394 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0679  hypothetical protein  38.12 
 
 		 374 aa  297  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.323848  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3837  hypothetical protein  43.7 
 
 		 375 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal  0.855927 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1865  hypothetical protein  40.45 
 
 		 406 aa  297  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.164344  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3142  hypothetical protein  45.79 
 
 		 386 aa  297  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0531471 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3828  hypothetical protein  42.89 
 
 		 375 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210412  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2802  hypothetical protein  42.93 
 
 		 398 aa  297  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0294833  normal  0.670826 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3841  hypothetical protein  40.05 
 
 		 416 aa  296  5e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.614644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3045  hypothetical protein  45.28 
 
 		 411 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0437  hypothetical protein  42.04 
 
 		 387 aa  295  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2105  hypothetical protein  45.01 
 
 		 438 aa  294  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0252  hypothetical protein  44.19 
 
 		 393 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1425  hypothetical protein  40.39 
 
 		 414 aa  293  5e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.625932  normal  0.472174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4543  hypothetical protein  44.02 
 
 		 403 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1444  protein of unknown function DUF482  43.39 
 
 		 411 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1656  hypothetical protein  37.27 
 
 		 433 aa  290  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2786  hypothetical protein  45.26 
 
 		 381 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1575  protein of unknown function DUF482  43.18 
 
 		 396 aa  288  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.645858  normal  0.365702 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1930  protein of unknown function DUF482  44.85 
 
 		 374 aa  287  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.207995 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2450  hypothetical protein  41.15 
 
 		 417 aa  287  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.456626  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2322  hypothetical protein  44.53 
 
 		 427 aa  287  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.483949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0166  protein of unknown function DUF482  43.08 
 
 		 405 aa  287  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0717665  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1294  hypothetical protein  42.33 
 
 		 393 aa  287  2.9999999999999996e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.724983  normal  0.811045 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1793  hypothetical protein  43.92 
 
 		 382 aa  286  5e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426104  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2329  hypothetical protein  39.54 
 
 		 392 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653635  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1121  hypothetical protein  42.78 
 
 		 395 aa  285  7e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3103  hypothetical protein  44.79 
 
 		 376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.73421  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0063  hypothetical protein  40.1 
 
 		 386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1772  protein of unknown function DUF482  42.34 
 
 		 396 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118924  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>