150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2308 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2308  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  943    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0870816  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1708  hypothetical protein  68.51 
 
 		 418 aa  632  1e-180  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0114  hypothetical protein  67.33 
 
 		 421 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139598  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2359  protein of unknown function DUF482  63.82 
 
 		 393 aa  573  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.597494  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3121  hypothetical protein  57.91 
 
 		 438 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1736  hypothetical protein  57.11 
 
 		 414 aa  497  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.327747 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4876  hypothetical protein  54.95 
 
 		 407 aa  490  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1962  protein of unknown function DUF482  54.61 
 
 		 456 aa  487  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.846465  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1760  hypothetical protein  54.61 
 
 		 406 aa  487  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2114  hypothetical protein  50.45 
 
 		 391 aa  431  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0393548 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2969  hypothetical protein  52.21 
 
 		 381 aa  425  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2348  hypothetical protein  48.02 
 
 		 408 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291454  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0679  hypothetical protein  47.79 
 
 		 400 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2323  hypothetical protein  47.66 
 
 		 392 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.471895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2611  hypothetical protein  48.46 
 
 		 415 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2170  hypothetical protein  45.86 
 
 		 390 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164145  hitchhiker  0.00000155889 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0877  hypothetical protein  47.54 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5740  hypothetical protein  46.77 
 
 		 392 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1801  hypothetical protein  46.55 
 
 		 392 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2413  hypothetical protein  46.55 
 
 		 392 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2417  hypothetical protein  46.77 
 
 		 392 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.673667  normal  0.0190965 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1116  protein of unknown function DUF482  46.53 
 
 		 389 aa  388  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.492606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3397  hypothetical protein  46.53 
 
 		 389 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2458  hypothetical protein  47.93 
 
 		 374 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0881  hypothetical protein  45.43 
 
 		 410 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642732  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2159  protein of unknown function DUF482  48.33 
 
 		 410 aa  385  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.296465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1241  hypothetical protein  45.96 
 
 		 464 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3011  hypothetical protein  45.74 
 
 		 392 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350718  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1083  hypothetical protein  45.96 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1088  hypothetical protein  45.96 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267189  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1586  hypothetical protein  45.74 
 
 		 392 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215515  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2563  protein of unknown function DUF482  47.78 
 
 		 410 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.871216  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0740  hypothetical protein  45.74 
 
 		 441 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.391728  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2273  hypothetical protein  45.74 
 
 		 392 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2534  hypothetical protein  43.72 
 
 		 384 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1758  protein of unknown function DUF482  46.64 
 
 		 426 aa  350  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0822  hypothetical protein  39.96 
 
 		 390 aa  342  9e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.295229  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0657  hypothetical protein  40.05 
 
 		 373 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0804  hypothetical protein  39.64 
 
 		 402 aa  312  6.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3017  hypothetical protein  36.32 
 
 		 384 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22410  hypothetical protein  38.62 
 
 		 374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000252116 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1930  hypothetical protein  35.67 
 
 		 405 aa  277  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0856188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3828  hypothetical protein  35.59 
 
 		 375 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210412  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19080  hypothetical protein  36.76 
 
 		 374 aa  273  4.0000000000000004e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1444  protein of unknown function DUF482  35.86 
 
 		 411 aa  272  8.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4050  hypothetical protein  36.78 
 
 		 375 aa  272  9e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1347  hypothetical protein  36.44 
 
 		 394 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1896  hypothetical protein  38.5 
 
 		 374 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4092  hypothetical protein  35.14 
 
 		 375 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4543  hypothetical protein  36.22 
 
 		 403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2802  hypothetical protein  36.16 
 
 		 398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0294833  normal  0.670826 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2475  hypothetical protein  35.46 
 
 		 395 aa  269  7e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.407377  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1377  hypothetical protein  36.78 
 
 		 397 aa  269  8e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0252  hypothetical protein  35.31 
 
 		 393 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1249  hypothetical protein  37.67 
 
 		 374 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3837  hypothetical protein  36.16 
 
 		 375 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal  0.855927 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2007  protein of unknown function DUF482  34.52 
 
 		 392 aa  263  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2025  hypothetical protein  34.66 
 
 		 405 aa  263  4.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2871  hypothetical protein  35.68 
 
 		 388 aa  263  6e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1865  hypothetical protein  34.05 
 
 		 406 aa  262  8e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.164344  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1930  protein of unknown function DUF482  36.4 
 
 		 374 aa  261  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.207995 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0437  hypothetical protein  34.82 
 
 		 387 aa  259  8e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2555  hypothetical protein  35.91 
 
 		 414 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2105  hypothetical protein  35.63 
 
 		 438 aa  258  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1167  hypothetical protein  34.81 
 
 		 395 aa  258  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0877771  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0896  hypothetical protein  36.14 
 
 		 414 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1665  hypothetical protein  35.13 
 
 		 418 aa  257  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.750799  normal  0.0965206 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4753  hypothetical protein  34.96 
 
 		 402 aa  257  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.51971 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1124  hypothetical protein  34.59 
 
 		 395 aa  256  4e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.326303  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4685  protein of unknown function DUF482  35.23 
 
 		 406 aa  256  5e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4316  hypothetical protein  35.23 
 
 		 406 aa  256  5e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1121  hypothetical protein  34.22 
 
 		 395 aa  256  6e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1114  protein of unknown function DUF482  36.1 
 
 		 392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.333144 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0943  hypothetical protein  36.24 
 
 		 380 aa  254  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118065  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0063  hypothetical protein  35.92 
 
 		 386 aa  254  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4593  hypothetical protein  34.36 
 
 		 405 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3548  protein of unknown function DUF482  35 
 
 		 409 aa  253  6e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1715  hypothetical protein  35.87 
 
 		 377 aa  252  8.000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2329  hypothetical protein  34.07 
 
 		 392 aa  251  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653635  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2406  hypothetical protein  33.4 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.688762  normal  0.186145 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0745  protein of unknown function DUF482  35.52 
 
 		 413 aa  251  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00828305 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2085  hypothetical protein  34.41 
 
 		 446 aa  250  3e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.817202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3841  hypothetical protein  33.85 
 
 		 416 aa  250  5e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.614644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1425  hypothetical protein  32.77 
 
 		 414 aa  249  6e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.625932  normal  0.472174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2458  hypothetical protein  36.02 
 
 		 423 aa  249  7e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4833  protein of unknown function DUF482  35.11 
 
 		 406 aa  249  7e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261808  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3315  hypothetical protein  34.99 
 
 		 406 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.479503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1656  hypothetical protein  33.05 
 
 		 433 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0679  hypothetical protein  31.45 
 
 		 374 aa  245  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.323848  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0702  hypothetical protein  34.61 
 
 		 378 aa  245  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2157  hypothetical protein  32.92 
 
 		 455 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.391826  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1793  hypothetical protein  37.03 
 
 		 382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426104  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1772  protein of unknown function DUF482  34.81 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3045  hypothetical protein  35.32 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2786  hypothetical protein  36.71 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2322  hypothetical protein  34.73 
 
 		 427 aa  244  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.483949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0166  protein of unknown function DUF482  33.63 
 
 		 405 aa  243  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0717665  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2533  hypothetical protein  33.92 
 
 		 402 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.941945  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0790  hypothetical protein  34.16 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0135  protein of unknown function DUF482  32.74 
 
 		 406 aa  240  4e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>