154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2871 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2871  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  807    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22410  hypothetical protein  49.87 
 
 
374 aa  371  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000252116 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19080  hypothetical protein  50 
 
 
374 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3837  hypothetical protein  47.23 
 
 
375 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal  0.855927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1347  hypothetical protein  46.51 
 
 
394 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1896  hypothetical protein  49.61 
 
 
374 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4543  hypothetical protein  46.25 
 
 
403 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4050  hypothetical protein  46.58 
 
 
375 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1249  hypothetical protein  48.29 
 
 
374 aa  350  3e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25813 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0063  hypothetical protein  47.64 
 
 
386 aa  347  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405281  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3828  hypothetical protein  47.18 
 
 
375 aa  345  6e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210412  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1930  hypothetical protein  45 
 
 
405 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0856188 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0166  protein of unknown function DUF482  45.13 
 
 
405 aa  342  5e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0717665  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4593  hypothetical protein  44.87 
 
 
405 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4092  hypothetical protein  45.97 
 
 
375 aa  342  9e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1425  hypothetical protein  45.79 
 
 
374 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.345024 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2157  hypothetical protein  43.24 
 
 
455 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.391826  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1865  hypothetical protein  44.85 
 
 
406 aa  327  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.164344  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4316  hypothetical protein  43.04 
 
 
406 aa  324  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4685  protein of unknown function DUF482  43.04 
 
 
406 aa  325  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3312  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2322  hypothetical protein  43.26 
 
 
427 aa  323  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.483949 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2296  hypothetical protein  43.91 
 
 
421 aa  323  4e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.124232  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1114  protein of unknown function DUF482  44.19 
 
 
392 aa  322  6e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.333144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3548  protein of unknown function DUF482  45.45 
 
 
409 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0679  hypothetical protein  43.01 
 
 
374 aa  320  1.9999999999999998e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.323848  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1377  hypothetical protein  44.38 
 
 
397 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0804  hypothetical protein  44.56 
 
 
402 aa  317  2e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1656  hypothetical protein  40.42 
 
 
433 aa  317  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2406  hypothetical protein  41.58 
 
 
411 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.688762  normal  0.186145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4753  hypothetical protein  42.86 
 
 
402 aa  317  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.51971 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3045  hypothetical protein  45.04 
 
 
411 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2329  hypothetical protein  43.04 
 
 
392 aa  315  9e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653635  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2486  hypothetical protein  43.2 
 
 
421 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.954327  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4833  protein of unknown function DUF482  45.74 
 
 
406 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261808  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2458  hypothetical protein  44.02 
 
 
423 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0943  hypothetical protein  47.37 
 
 
380 aa  312  5.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118065  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1425  hypothetical protein  40 
 
 
414 aa  311  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.625932  normal  0.472174 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2323  hypothetical protein  43.34 
 
 
392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.471895  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1294  hypothetical protein  42.27 
 
 
393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.724983  normal  0.811045 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3841  hypothetical protein  43.41 
 
 
416 aa  309  6.999999999999999e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.614644  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2417  hypothetical protein  43.19 
 
 
392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.673667  normal  0.0190965 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3315  hypothetical protein  42.98 
 
 
406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.479503  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1575  protein of unknown function DUF482  42.63 
 
 
396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.645858  normal  0.365702 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3017  hypothetical protein  42.05 
 
 
384 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5740  hypothetical protein  43.31 
 
 
392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0881  hypothetical protein  43.57 
 
 
410 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642732  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2533  hypothetical protein  41.12 
 
 
402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.941945  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0822  hypothetical protein  43.09 
 
 
390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.295229  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2786  hypothetical protein  45.36 
 
 
381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1772  protein of unknown function DUF482  42.36 
 
 
396 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118924  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0877  hypothetical protein  43.46 
 
 
392 aa  306  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3791  hypothetical protein  43.92 
 
 
390 aa  305  9.000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1801  hypothetical protein  42.41 
 
 
392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2413  hypothetical protein  42.41 
 
 
392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3011  hypothetical protein  42.01 
 
 
392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1586  hypothetical protein  42.01 
 
 
392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215515  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1241  hypothetical protein  42.01 
 
 
464 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2734  hypothetical protein  42.78 
 
 
385 aa  303  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2273  hypothetical protein  42.01 
 
 
392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1083  hypothetical protein  42.01 
 
 
441 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1088  hypothetical protein  42.01 
 
 
441 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267189  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1953  hypothetical protein  43.2 
 
 
432 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0740  hypothetical protein  42.01 
 
 
441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.391728  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2368  hypothetical protein  43.69 
 
 
398 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0181768  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2458  hypothetical protein  43.12 
 
 
374 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2170  hypothetical protein  41.88 
 
 
390 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164145  hitchhiker  0.00000155889 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2450  hypothetical protein  42.9 
 
 
417 aa  300  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.456626  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1121  hypothetical protein  41.82 
 
 
395 aa  301  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1140  hypothetical protein  37.92 
 
 
394 aa  298  8e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2105  hypothetical protein  43.04 
 
 
438 aa  298  8e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02848  hypothetical protein  40.2 
 
 
445 aa  296  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.29586  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3397  hypothetical protein  41.84 
 
 
389 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6252  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1665  hypothetical protein  44.94 
 
 
418 aa  295  7e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.750799  normal  0.0965206 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2025  hypothetical protein  40.9 
 
 
405 aa  295  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3103  hypothetical protein  45.15 
 
 
376 aa  294  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.73421  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2007  protein of unknown function DUF482  40.16 
 
 
392 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1116  protein of unknown function DUF482  41.58 
 
 
389 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.492606  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1167  hypothetical protein  39.34 
 
 
395 aa  292  8e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0877771  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2611  hypothetical protein  42.38 
 
 
415 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1124  hypothetical protein  39.09 
 
 
395 aa  291  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.326303  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1715  hypothetical protein  42.71 
 
 
377 aa  290  3e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0679  hypothetical protein  41.6 
 
 
400 aa  289  6e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2802  hypothetical protein  42.36 
 
 
398 aa  289  6e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0294833  normal  0.670826 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1668  hypothetical protein  41.41 
 
 
427 aa  289  7e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1728  protein of unknown function DUF482  38.68 
 
 
470 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0347307  normal  0.0114903 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1793  hypothetical protein  42.26 
 
 
382 aa  286  4e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426104  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2348  hypothetical protein  40.98 
 
 
408 aa  286  4e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291454  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3885  protein of unknown function DUF482  41.23 
 
 
411 aa  286  4e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854025  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2534  hypothetical protein  40.94 
 
 
384 aa  286  5.999999999999999e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1444  protein of unknown function DUF482  40.87 
 
 
411 aa  285  9e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2657  hypothetical protein  38.68 
 
 
470 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00609498  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2159  protein of unknown function DUF482  41.32 
 
 
410 aa  280  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.296465  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3121  hypothetical protein  38.89 
 
 
438 aa  279  6e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0657  hypothetical protein  41.22 
 
 
373 aa  279  7e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2563  protein of unknown function DUF482  41.05 
 
 
410 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.871216  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3142  hypothetical protein  43.09 
 
 
386 aa  276  4e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0531471 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2475  hypothetical protein  38.7 
 
 
395 aa  276  4e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.407377  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4876  hypothetical protein  38.73 
 
 
407 aa  276  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239884  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1708  hypothetical protein  40.16 
 
 
418 aa  276  5e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0252  hypothetical protein  41.53 
 
 
393 aa  276  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.349993 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>