150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1715 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1715  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  782    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2007  protein of unknown function DUF482  50 
 
 
392 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2534  hypothetical protein  46.05 
 
 
384 aa  347  2e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2273  hypothetical protein  43.68 
 
 
392 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3011  hypothetical protein  43.68 
 
 
392 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1586  hypothetical protein  43.68 
 
 
392 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215515  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0740  hypothetical protein  43.68 
 
 
441 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.391728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1083  hypothetical protein  43.68 
 
 
441 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1088  hypothetical protein  43.68 
 
 
441 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267189  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1241  hypothetical protein  43.68 
 
 
464 aa  329  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2458  hypothetical protein  43.8 
 
 
423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1114  protein of unknown function DUF482  44.53 
 
 
392 aa  326  4.0000000000000003e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.333144 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2105  hypothetical protein  46.67 
 
 
438 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1116  protein of unknown function DUF482  43.42 
 
 
389 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.492606  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0881  hypothetical protein  44.2 
 
 
410 aa  325  7e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642732  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3397  hypothetical protein  43.42 
 
 
389 aa  325  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6252  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1793  hypothetical protein  45.89 
 
 
382 aa  325  9e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426104  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0822  hypothetical protein  44.83 
 
 
390 aa  325  9e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.295229  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2170  hypothetical protein  43.05 
 
 
390 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164145  hitchhiker  0.00000155889 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2323  hypothetical protein  44.09 
 
 
392 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.471895  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1444  protein of unknown function DUF482  44.3 
 
 
411 aa  322  7e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3315  hypothetical protein  45.5 
 
 
406 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.479503  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2458  hypothetical protein  44.12 
 
 
374 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0877  hypothetical protein  43.83 
 
 
392 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2417  hypothetical protein  43.57 
 
 
392 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.673667  normal  0.0190965 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5740  hypothetical protein  43.57 
 
 
392 aa  319  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1801  hypothetical protein  43.04 
 
 
392 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2413  hypothetical protein  43.04 
 
 
392 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1140  hypothetical protein  40.79 
 
 
394 aa  316  5e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1377  hypothetical protein  43.01 
 
 
397 aa  314  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1930  protein of unknown function DUF482  45.04 
 
 
374 aa  313  3.9999999999999997e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.207995 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2406  hypothetical protein  44.32 
 
 
411 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.688762  normal  0.186145 
 
 
-
 
NC_004310  BR1167  hypothetical protein  43.04 
 
 
395 aa  311  9e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0877771  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1425  hypothetical protein  45.61 
 
 
414 aa  310  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.625932  normal  0.472174 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2475  hypothetical protein  42.97 
 
 
395 aa  310  2e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.407377  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2871  hypothetical protein  42.71 
 
 
388 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1124  hypothetical protein  42.78 
 
 
395 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.326303  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3548  protein of unknown function DUF482  44.38 
 
 
409 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0657  hypothetical protein  44.03 
 
 
373 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2450  hypothetical protein  44.48 
 
 
417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.456626  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2786  hypothetical protein  45.04 
 
 
381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0804  hypothetical protein  42.52 
 
 
402 aa  305  6e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0437  hypothetical protein  42.26 
 
 
387 aa  305  6e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0896  hypothetical protein  43.08 
 
 
414 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0702  hypothetical protein  43.01 
 
 
378 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3045  hypothetical protein  45.61 
 
 
411 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0166  protein of unknown function DUF482  43.93 
 
 
405 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0717665  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2802  hypothetical protein  41.8 
 
 
398 aa  303  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0294833  normal  0.670826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4753  hypothetical protein  41.33 
 
 
402 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.51971 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2734  hypothetical protein  42.29 
 
 
385 aa  302  5.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4593  hypothetical protein  43.93 
 
 
405 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0790  hypothetical protein  42.74 
 
 
378 aa  302  7.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01036  hypothetical protein  43.9 
 
 
388 aa  301  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479769  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06130  hypothetical protein  43.9 
 
 
388 aa  301  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.187585  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2025  hypothetical protein  42.63 
 
 
405 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1865  hypothetical protein  42.48 
 
 
406 aa  301  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.164344  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2555  hypothetical protein  42.56 
 
 
414 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3885  protein of unknown function DUF482  42.49 
 
 
411 aa  300  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854025  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1294  hypothetical protein  42.63 
 
 
393 aa  300  3e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.724983  normal  0.811045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4685  protein of unknown function DUF482  43.51 
 
 
406 aa  300  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3312  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0252  hypothetical protein  42.45 
 
 
393 aa  299  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4316  hypothetical protein  43.24 
 
 
406 aa  299  7e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2322  hypothetical protein  44.32 
 
 
427 aa  298  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.483949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1249  hypothetical protein  43.77 
 
 
374 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25813 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0135  protein of unknown function DUF482  42.45 
 
 
406 aa  297  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4833  protein of unknown function DUF482  44.5 
 
 
406 aa  296  4e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261808  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22410  hypothetical protein  43.24 
 
 
374 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000252116 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0745  protein of unknown function DUF482  45.17 
 
 
413 aa  294  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00828305 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3017  hypothetical protein  38.83 
 
 
384 aa  293  4e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1758  protein of unknown function DUF482  42 
 
 
426 aa  293  4e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3005  hypothetical protein  44.13 
 
 
383 aa  292  7e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2348  hypothetical protein  40.16 
 
 
408 aa  292  8e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291454  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2157  hypothetical protein  39.39 
 
 
455 aa  291  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.391826  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2611  hypothetical protein  41.04 
 
 
415 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1930  hypothetical protein  39.5 
 
 
405 aa  290  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0856188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3828  hypothetical protein  41.11 
 
 
375 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210412  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19080  hypothetical protein  42.44 
 
 
374 aa  289  6e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1896  hypothetical protein  44.2 
 
 
374 aa  289  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2329  hypothetical protein  40.26 
 
 
392 aa  288  8e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653635  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4092  hypothetical protein  41.11 
 
 
375 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0679  hypothetical protein  37.77 
 
 
374 aa  286  2.9999999999999996e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.323848  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3103  hypothetical protein  41.29 
 
 
376 aa  286  5e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.73421  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2563  protein of unknown function DUF482  40.21 
 
 
410 aa  286  5e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.871216  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3841  hypothetical protein  39.55 
 
 
416 aa  286  5.999999999999999e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.614644  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2159  protein of unknown function DUF482  39.95 
 
 
410 aa  285  7e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.296465  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1656  hypothetical protein  36.83 
 
 
433 aa  285  8e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0679  hypothetical protein  39.9 
 
 
400 aa  285  9e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4543  hypothetical protein  42.28 
 
 
403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1665  hypothetical protein  38.42 
 
 
418 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.750799  normal  0.0965206 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2533  hypothetical protein  39.69 
 
 
402 aa  283  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.941945  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1347  hypothetical protein  42.28 
 
 
394 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2969  hypothetical protein  42.93 
 
 
381 aa  283  5.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3142  hypothetical protein  44.09 
 
 
386 aa  283  5.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0531471 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2114  hypothetical protein  40.75 
 
 
391 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0393548 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4050  hypothetical protein  42.28 
 
 
375 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2359  protein of unknown function DUF482  40 
 
 
393 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.597494  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1772  protein of unknown function DUF482  39.74 
 
 
396 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118924  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3791  hypothetical protein  40.74 
 
 
390 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1708  hypothetical protein  37.91 
 
 
418 aa  279  5e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1121  hypothetical protein  38.96 
 
 
395 aa  279  5e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>