155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2359 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2359  protein of unknown function DUF482  100 
 
 		 393 aa  811    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.597494  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1708  hypothetical protein  70.52 
 
 		 418 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0114  hypothetical protein  67.8 
 
 		 421 aa  555  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139598  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2308  hypothetical protein  63.82 
 
 		 451 aa  554  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0870816  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3121  hypothetical protein  68.43 
 
 		 438 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1736  hypothetical protein  66.34 
 
 		 414 aa  538  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.327747 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1962  protein of unknown function DUF482  64.05 
 
 		 456 aa  521  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.846465  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1760  hypothetical protein  64.05 
 
 		 406 aa  521  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4876  hypothetical protein  60.99 
 
 		 407 aa  501  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2114  hypothetical protein  61.6 
 
 		 391 aa  473  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0393548 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2969  hypothetical protein  62.2 
 
 		 381 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0679  hypothetical protein  56.28 
 
 		 400 aa  441  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2348  hypothetical protein  55.44 
 
 		 408 aa  431  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291454  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2159  protein of unknown function DUF482  57.22 
 
 		 410 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.296465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2611  hypothetical protein  55.92 
 
 		 415 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2563  protein of unknown function DUF482  56.2 
 
 		 410 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.871216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3397  hypothetical protein  53.96 
 
 		 389 aa  425  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1116  protein of unknown function DUF482  53.71 
 
 		 389 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.492606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2170  hypothetical protein  53.06 
 
 		 390 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164145  hitchhiker  0.00000155889 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5740  hypothetical protein  52.67 
 
 		 392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0881  hypothetical protein  52.42 
 
 		 410 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642732  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3011  hypothetical protein  52.16 
 
 		 392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1586  hypothetical protein  52.16 
 
 		 392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215515  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0740  hypothetical protein  52.16 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.391728  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1241  hypothetical protein  52.16 
 
 		 464 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0877  hypothetical protein  53.18 
 
 		 392 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2273  hypothetical protein  52.16 
 
 		 392 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1083  hypothetical protein  52.16 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1088  hypothetical protein  52.16 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267189  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2323  hypothetical protein  52.17 
 
 		 392 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.471895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1801  hypothetical protein  52.42 
 
 		 392 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2413  hypothetical protein  52.42 
 
 		 392 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2417  hypothetical protein  52.67 
 
 		 392 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.673667  normal  0.0190965 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2458  hypothetical protein  53.74 
 
 		 374 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2534  hypothetical protein  51.28 
 
 		 384 aa  390  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1758  protein of unknown function DUF482  51.52 
 
 		 426 aa  365  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0804  hypothetical protein  49.61 
 
 		 402 aa  360  2e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0822  hypothetical protein  44.5 
 
 		 390 aa  357  2.9999999999999997e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.295229  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0657  hypothetical protein  46.63 
 
 		 373 aa  345  8e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3828  hypothetical protein  44.44 
 
 		 375 aa  325  6e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210412  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4050  hypothetical protein  46.35 
 
 		 375 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3837  hypothetical protein  46.11 
 
 		 375 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal  0.855927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1347  hypothetical protein  46.11 
 
 		 394 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4092  hypothetical protein  43.93 
 
 		 375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4543  hypothetical protein  45.6 
 
 		 403 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19080  hypothetical protein  45.8 
 
 		 374 aa  316  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22410  hypothetical protein  45.36 
 
 		 374 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000252116 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1249  hypothetical protein  45.01 
 
 		 374 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25813 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1444  protein of unknown function DUF482  44.27 
 
 		 411 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2475  hypothetical protein  43.65 
 
 		 395 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.407377  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3017  hypothetical protein  40.31 
 
 		 384 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2105  hypothetical protein  43.88 
 
 		 438 aa  299  4e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1896  hypothetical protein  45.19 
 
 		 374 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1425  hypothetical protein  41.34 
 
 		 374 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345024 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1665  hypothetical protein  41.26 
 
 		 418 aa  294  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.750799  normal  0.0965206 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2802  hypothetical protein  42.49 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0294833  normal  0.670826 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1930  hypothetical protein  39 
 
 		 405 aa  293  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0856188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3791  hypothetical protein  41.92 
 
 		 390 aa  293  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1121  hypothetical protein  41.21 
 
 		 395 aa  293  5e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1377  hypothetical protein  40.91 
 
 		 397 aa  290  4e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0943  hypothetical protein  43.73 
 
 		 380 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118065  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0437  hypothetical protein  42.97 
 
 		 387 aa  289  6e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2734  hypothetical protein  41.73 
 
 		 385 aa  289  7e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0252  hypothetical protein  43.18 
 
 		 393 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1865  hypothetical protein  39.4 
 
 		 406 aa  286  4e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.164344  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2329  hypothetical protein  40.9 
 
 		 392 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653635  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2555  hypothetical protein  43.29 
 
 		 414 aa  285  7e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1930  protein of unknown function DUF482  42.38 
 
 		 374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.207995 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0896  hypothetical protein  43.29 
 
 		 414 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3841  hypothetical protein  37.93 
 
 		 416 aa  281  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.614644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4753  hypothetical protein  39.07 
 
 		 402 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.51971 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1114  protein of unknown function DUF482  41.84 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.333144 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4685  protein of unknown function DUF482  41.06 
 
 		 406 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2007  protein of unknown function DUF482  40.46 
 
 		 392 aa  280  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4316  hypothetical protein  40.81 
 
 		 406 aa  280  4e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4593  hypothetical protein  40.95 
 
 		 405 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2533  hypothetical protein  38.81 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.941945  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2458  hypothetical protein  41.62 
 
 		 423 aa  276  3e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0063  hypothetical protein  39.44 
 
 		 386 aa  277  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1772  protein of unknown function DUF482  38.31 
 
 		 396 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3548  protein of unknown function DUF482  40.37 
 
 		 409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1575  protein of unknown function DUF482  38.96 
 
 		 396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.645858  normal  0.365702 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0135  protein of unknown function DUF482  41.12 
 
 		 406 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0166  protein of unknown function DUF482  39.5 
 
 		 405 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0717665  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2025  hypothetical protein  39.14 
 
 		 405 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2322  hypothetical protein  40.2 
 
 		 427 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.483949 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2296  hypothetical protein  37.07 
 
 		 421 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.124232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4833  protein of unknown function DUF482  40.3 
 
 		 406 aa  270  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261808  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3103  hypothetical protein  43.08 
 
 		 376 aa  267  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.73421  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2871  hypothetical protein  38.07 
 
 		 388 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2786  hypothetical protein  42.93 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2486  hypothetical protein  37.3 
 
 		 421 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.954327  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0745  protein of unknown function DUF482  43.01 
 
 		 413 aa  266  4e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00828305 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06130  hypothetical protein  40 
 
 		 388 aa  265  7e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.187585  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01036  hypothetical protein  40 
 
 		 388 aa  265  7e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479769  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0702  hypothetical protein  37.66 
 
 		 378 aa  264  2e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1167  hypothetical protein  38.13 
 
 		 395 aa  263  3e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0877771  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1656  hypothetical protein  37.25 
 
 		 433 aa  263  4e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0679  hypothetical protein  34.19 
 
 		 374 aa  263  4.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.323848  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1715  hypothetical protein  40 
 
 		 377 aa  262  6.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>