153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3791 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3791  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  795    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1377  hypothetical protein  64.16 
 
 
397 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4753  hypothetical protein  61.56 
 
 
402 aa  484  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.51971 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1121  hypothetical protein  62.05 
 
 
395 aa  482  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2406  hypothetical protein  60.5 
 
 
411 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.688762  normal  0.186145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3548  protein of unknown function DUF482  63.91 
 
 
409 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1575  protein of unknown function DUF482  60.1 
 
 
396 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.645858  normal  0.365702 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2322  hypothetical protein  63.66 
 
 
427 aa  476  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.483949 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2533  hypothetical protein  60.51 
 
 
402 aa  474  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.941945  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1772  protein of unknown function DUF482  59.03 
 
 
396 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118924  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3315  hypothetical protein  63.54 
 
 
406 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.479503  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3045  hypothetical protein  65.16 
 
 
411 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0166  protein of unknown function DUF482  60.66 
 
 
405 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0717665  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2802  hypothetical protein  58.18 
 
 
398 aa  469  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0294833  normal  0.670826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1425  hypothetical protein  59.34 
 
 
414 aa  464  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.625932  normal  0.472174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4593  hypothetical protein  59.49 
 
 
405 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2450  hypothetical protein  57.14 
 
 
417 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.456626  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2025  hypothetical protein  59.42 
 
 
405 aa  459  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1167  hypothetical protein  58.85 
 
 
395 aa  457  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0877771  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1124  hypothetical protein  58.85 
 
 
395 aa  457  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.326303  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4685  protein of unknown function DUF482  59.29 
 
 
406 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3312  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4316  hypothetical protein  59.03 
 
 
406 aa  451  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4833  protein of unknown function DUF482  58.59 
 
 
406 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261808  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1665  hypothetical protein  54.94 
 
 
418 aa  433  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.750799  normal  0.0965206 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2475  hypothetical protein  54.24 
 
 
395 aa  419  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.407377  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2734  hypothetical protein  55.61 
 
 
385 aa  421  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2786  hypothetical protein  59.15 
 
 
381 aa  419  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0745  protein of unknown function DUF482  52.07 
 
 
413 aa  403  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00828305 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3142  hypothetical protein  57.07 
 
 
386 aa  402  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0531471 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0252  hypothetical protein  55.53 
 
 
393 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3103  hypothetical protein  55.97 
 
 
376 aa  401  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.73421  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0896  hypothetical protein  56.05 
 
 
414 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1294  hypothetical protein  54.23 
 
 
393 aa  396  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.724983  normal  0.811045 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1114  protein of unknown function DUF482  53.05 
 
 
392 aa  392  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.333144 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2555  hypothetical protein  55.26 
 
 
414 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0437  hypothetical protein  52.51 
 
 
387 aa  389  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0135  protein of unknown function DUF482  51.16 
 
 
406 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2458  hypothetical protein  50.92 
 
 
423 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2105  hypothetical protein  50.52 
 
 
438 aa  365  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3005  hypothetical protein  55.52 
 
 
383 aa  360  2e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4050  hypothetical protein  47.77 
 
 
375 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3837  hypothetical protein  47.77 
 
 
375 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal  0.855927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4543  hypothetical protein  47.35 
 
 
403 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1347  hypothetical protein  47.26 
 
 
394 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22410  hypothetical protein  47.63 
 
 
374 aa  319  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000252116 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4092  hypothetical protein  45.5 
 
 
375 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3828  hypothetical protein  45.17 
 
 
375 aa  315  8e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210412  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0679  hypothetical protein  45.34 
 
 
400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1249  hypothetical protein  45.43 
 
 
374 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1425  hypothetical protein  44.74 
 
 
374 aa  310  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.345024 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19080  hypothetical protein  46.44 
 
 
374 aa  310  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2534  hypothetical protein  43.22 
 
 
384 aa  309  5e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0822  hypothetical protein  42.78 
 
 
390 aa  309  5.9999999999999995e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.295229  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0877  hypothetical protein  45.05 
 
 
392 aa  308  8e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0657  hypothetical protein  43.92 
 
 
373 aa  307  3e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2871  hypothetical protein  43.92 
 
 
388 aa  305  9.000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2159  protein of unknown function DUF482  46.1 
 
 
410 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.296465  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0881  hypothetical protein  44.82 
 
 
410 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642732  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3011  hypothetical protein  45.13 
 
 
392 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1586  hypothetical protein  45.13 
 
 
392 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215515  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2273  hypothetical protein  45.13 
 
 
392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0740  hypothetical protein  44.56 
 
 
441 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.391728  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1241  hypothetical protein  45.13 
 
 
464 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1930  hypothetical protein  40.84 
 
 
405 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0856188 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1801  hypothetical protein  44.24 
 
 
392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2413  hypothetical protein  44.24 
 
 
392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1083  hypothetical protein  44.56 
 
 
441 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1088  hypothetical protein  44.56 
 
 
441 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267189  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2170  hypothetical protein  43.19 
 
 
390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164145  hitchhiker  0.00000155889 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5740  hypothetical protein  44.68 
 
 
392 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1896  hypothetical protein  48.31 
 
 
374 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3397  hypothetical protein  42.78 
 
 
389 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6252  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2417  hypothetical protein  44.5 
 
 
392 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.673667  normal  0.0190965 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2323  hypothetical protein  44.76 
 
 
392 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.471895  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2611  hypothetical protein  44.59 
 
 
415 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1116  protein of unknown function DUF482  42.52 
 
 
389 aa  300  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.492606  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2348  hypothetical protein  44.47 
 
 
408 aa  296  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291454  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0804  hypothetical protein  43.67 
 
 
402 aa  296  3e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2458  hypothetical protein  45.19 
 
 
374 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2563  protein of unknown function DUF482  45.41 
 
 
410 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.871216  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3885  protein of unknown function DUF482  43.36 
 
 
411 aa  294  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854025  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2359  protein of unknown function DUF482  41.92 
 
 
393 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.597494  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1758  protein of unknown function DUF482  43.46 
 
 
426 aa  292  6e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1140  hypothetical protein  37.31 
 
 
394 aa  285  7e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2114  hypothetical protein  43.8 
 
 
391 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0393548 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2007  protein of unknown function DUF482  39.68 
 
 
392 aa  280  4e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3017  hypothetical protein  38.79 
 
 
384 aa  276  4e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2969  hypothetical protein  43.92 
 
 
381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2157  hypothetical protein  39.14 
 
 
455 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.391826  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1865  hypothetical protein  39.84 
 
 
406 aa  270  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.164344  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3841  hypothetical protein  37.6 
 
 
416 aa  268  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.614644  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01036  hypothetical protein  41.29 
 
 
388 aa  268  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479769  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06130  hypothetical protein  41.29 
 
 
388 aa  268  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.187585  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0063  hypothetical protein  40.21 
 
 
386 aa  268  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405281  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1444  protein of unknown function DUF482  40.71 
 
 
411 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2329  hypothetical protein  38.12 
 
 
392 aa  264  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653635  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1715  hypothetical protein  40.74 
 
 
377 aa  263  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1793  hypothetical protein  41.58 
 
 
382 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426104  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3121  hypothetical protein  40.41 
 
 
438 aa  261  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1708  hypothetical protein  38.31 
 
 
418 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>