150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2413 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0740  hypothetical protein  81.7 
 
 
441 aa  664    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.391728  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2323  hypothetical protein  95.41 
 
 
392 aa  775    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.471895  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1241  hypothetical protein  81.96 
 
 
464 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5740  hypothetical protein  96.93 
 
 
392 aa  788    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0881  hypothetical protein  82.22 
 
 
410 aa  672    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642732  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3397  hypothetical protein  78.61 
 
 
389 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6252  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1801  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  810    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2458  hypothetical protein  94.12 
 
 
374 aa  730    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2413  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  810    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2273  hypothetical protein  81.96 
 
 
392 aa  665    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0877  hypothetical protein  95.38 
 
 
392 aa  774    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2417  hypothetical protein  98.72 
 
 
392 aa  801    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.673667  normal  0.0190965 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3011  hypothetical protein  81.7 
 
 
392 aa  663    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350718  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1083  hypothetical protein  81.96 
 
 
441 aa  664    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1088  hypothetical protein  81.96 
 
 
441 aa  664    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267189  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1586  hypothetical protein  81.7 
 
 
392 aa  663    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215515  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1116  protein of unknown function DUF482  78.61 
 
 
389 aa  644    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.492606  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2170  hypothetical protein  79.18 
 
 
390 aa  653    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164145  hitchhiker  0.00000155889 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0679  hypothetical protein  63.92 
 
 
400 aa  507  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2611  hypothetical protein  65.97 
 
 
415 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2563  protein of unknown function DUF482  65.23 
 
 
410 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.871216  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2159  protein of unknown function DUF482  64.45 
 
 
410 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.296465  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2348  hypothetical protein  62.4 
 
 
408 aa  480  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291454  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1708  hypothetical protein  55.17 
 
 
418 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2534  hypothetical protein  54.26 
 
 
384 aa  411  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2359  protein of unknown function DUF482  52.42 
 
 
393 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.597494  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0822  hypothetical protein  50.39 
 
 
390 aa  395  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.295229  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2969  hypothetical protein  54.93 
 
 
381 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3121  hypothetical protein  52.3 
 
 
438 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1736  hypothetical protein  53.3 
 
 
414 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.327747 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0114  hypothetical protein  50.24 
 
 
421 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139598  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4876  hypothetical protein  51.12 
 
 
407 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239884  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1760  hypothetical protein  52.99 
 
 
406 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2114  hypothetical protein  52.23 
 
 
391 aa  384  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0393548 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1962  protein of unknown function DUF482  52.99 
 
 
456 aa  381  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.846465  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2308  hypothetical protein  46.55 
 
 
451 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0870816  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0804  hypothetical protein  49.61 
 
 
402 aa  351  1e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0657  hypothetical protein  47.89 
 
 
373 aa  348  1e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1758  protein of unknown function DUF482  49.12 
 
 
426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22410  hypothetical protein  48.02 
 
 
374 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000252116 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1930  hypothetical protein  41.21 
 
 
405 aa  324  1e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0856188 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2007  protein of unknown function DUF482  45.48 
 
 
392 aa  322  8e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4685  protein of unknown function DUF482  47.51 
 
 
406 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3312  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2475  hypothetical protein  44.7 
 
 
395 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.407377  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2734  hypothetical protein  45 
 
 
385 aa  319  6e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4316  hypothetical protein  46.98 
 
 
406 aa  319  6e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1140  hypothetical protein  39.6 
 
 
394 aa  318  1e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1896  hypothetical protein  47.7 
 
 
374 aa  315  7e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1377  hypothetical protein  46.52 
 
 
397 aa  314  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1249  hypothetical protein  46.83 
 
 
374 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25813 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19080  hypothetical protein  45.79 
 
 
374 aa  313  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3017  hypothetical protein  42.41 
 
 
384 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2458  hypothetical protein  44.79 
 
 
423 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0745  protein of unknown function DUF482  47.35 
 
 
413 aa  309  5e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00828305 
 
 
-
 
NC_004310  BR1167  hypothetical protein  44.47 
 
 
395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0877771  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1124  hypothetical protein  44.47 
 
 
395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.326303  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1665  hypothetical protein  42.18 
 
 
418 aa  306  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.750799  normal  0.0965206 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2871  hypothetical protein  42.41 
 
 
388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3142  hypothetical protein  46.03 
 
 
386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0531471 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3791  hypothetical protein  44.24 
 
 
390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4833  protein of unknown function DUF482  46.49 
 
 
406 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261808  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2025  hypothetical protein  42.97 
 
 
405 aa  303  5.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4092  hypothetical protein  43.39 
 
 
375 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0679  hypothetical protein  38.38 
 
 
374 aa  300  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.323848  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4593  hypothetical protein  44.13 
 
 
405 aa  301  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2406  hypothetical protein  45.14 
 
 
411 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.688762  normal  0.186145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3548  protein of unknown function DUF482  44.39 
 
 
409 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3315  hypothetical protein  43.98 
 
 
406 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.479503  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4050  hypothetical protein  43.43 
 
 
375 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1715  hypothetical protein  43.04 
 
 
377 aa  298  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2555  hypothetical protein  44.24 
 
 
414 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3828  hypothetical protein  42.89 
 
 
375 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210412  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1425  hypothetical protein  42.48 
 
 
374 aa  297  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.345024 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0437  hypothetical protein  42.56 
 
 
387 aa  297  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0252  hypothetical protein  44.7 
 
 
393 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3841  hypothetical protein  40.51 
 
 
416 aa  297  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.614644  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0896  hypothetical protein  43.98 
 
 
414 aa  296  6e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2105  hypothetical protein  44.47 
 
 
438 aa  296  6e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3045  hypothetical protein  44.72 
 
 
411 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1865  hypothetical protein  38.69 
 
 
406 aa  294  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.164344  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2802  hypothetical protein  42.15 
 
 
398 aa  293  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0294833  normal  0.670826 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3837  hypothetical protein  42.9 
 
 
375 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal  0.855927 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1425  hypothetical protein  41.88 
 
 
414 aa  293  4e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.625932  normal  0.472174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1347  hypothetical protein  43.32 
 
 
394 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2786  hypothetical protein  45.68 
 
 
381 aa  292  6e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2322  hypothetical protein  44.79 
 
 
427 aa  289  6e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.483949 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3103  hypothetical protein  45.31 
 
 
376 aa  289  7e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.73421  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1656  hypothetical protein  37.05 
 
 
433 aa  289  7e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1121  hypothetical protein  43.33 
 
 
395 aa  288  8e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2450  hypothetical protein  41.88 
 
 
417 aa  288  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.456626  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1930  protein of unknown function DUF482  44.95 
 
 
374 aa  288  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.207995 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1444  protein of unknown function DUF482  42.39 
 
 
411 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4543  hypothetical protein  43.21 
 
 
403 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1793  hypothetical protein  43.31 
 
 
382 aa  286  4e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426104  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2329  hypothetical protein  39.8 
 
 
392 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653635  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0166  protein of unknown function DUF482  42.82 
 
 
405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0717665  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1294  hypothetical protein  41.53 
 
 
393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.724983  normal  0.811045 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1575  protein of unknown function DUF482  42.06 
 
 
396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.645858  normal  0.365702 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2533  hypothetical protein  43.8 
 
 
402 aa  283  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.941945  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2296  hypothetical protein  37.92 
 
 
421 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.124232  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>