151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4876 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4876  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  833    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1708  hypothetical protein  62.38 
 
 		 418 aa  505  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2359  protein of unknown function DUF482  60.99 
 
 		 393 aa  501  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.597494  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1760  hypothetical protein  63.22 
 
 		 406 aa  499  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1736  hypothetical protein  63.33 
 
 		 414 aa  498  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.327747 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1962  protein of unknown function DUF482  62.97 
 
 		 456 aa  496  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.846465  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3121  hypothetical protein  62.28 
 
 		 438 aa  485  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0114  hypothetical protein  58.33 
 
 		 421 aa  479  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139598  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2308  hypothetical protein  54.95 
 
 		 451 aa  478  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0870816  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2114  hypothetical protein  55.64 
 
 		 391 aa  427  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0393548 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2969  hypothetical protein  54.87 
 
 		 381 aa  415  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2170  hypothetical protein  51.13 
 
 		 390 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164145  hitchhiker  0.00000155889 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1116  protein of unknown function DUF482  51.75 
 
 		 389 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.492606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3397  hypothetical protein  51.75 
 
 		 389 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0679  hypothetical protein  51.23 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5740  hypothetical protein  51.74 
 
 		 392 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0877  hypothetical protein  52.12 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2417  hypothetical protein  51.37 
 
 		 392 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.673667  normal  0.0190965 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2611  hypothetical protein  50.62 
 
 		 415 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2323  hypothetical protein  51.62 
 
 		 392 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.471895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1801  hypothetical protein  51.12 
 
 		 392 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2413  hypothetical protein  51.12 
 
 		 392 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2348  hypothetical protein  49.51 
 
 		 408 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291454  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0881  hypothetical protein  51.5 
 
 		 410 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642732  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2159  protein of unknown function DUF482  52.61 
 
 		 410 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.296465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2563  protein of unknown function DUF482  51.61 
 
 		 410 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.871216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2458  hypothetical protein  52.05 
 
 		 374 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0740  hypothetical protein  50.74 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.391728  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1241  hypothetical protein  50.74 
 
 		 464 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2273  hypothetical protein  50.74 
 
 		 392 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1083  hypothetical protein  50.74 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1088  hypothetical protein  50.74 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267189  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3011  hypothetical protein  50.74 
 
 		 392 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1586  hypothetical protein  50.74 
 
 		 392 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215515  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0822  hypothetical protein  44.89 
 
 		 390 aa  360  2e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.295229  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0657  hypothetical protein  47.21 
 
 		 373 aa  352  7e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2534  hypothetical protein  45.66 
 
 		 384 aa  339  5e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1758  protein of unknown function DUF482  45.39 
 
 		 426 aa  323  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0804  hypothetical protein  44.55 
 
 		 402 aa  323  5e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1930  protein of unknown function DUF482  43.11 
 
 		 374 aa  297  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.207995 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3017  hypothetical protein  38.06 
 
 		 384 aa  296  4e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22410  hypothetical protein  42.33 
 
 		 374 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000252116 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3828  hypothetical protein  41.25 
 
 		 375 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210412  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1444  protein of unknown function DUF482  41.5 
 
 		 411 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4092  hypothetical protein  40.4 
 
 		 375 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1896  hypothetical protein  43.08 
 
 		 374 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2007  protein of unknown function DUF482  39.85 
 
 		 392 aa  282  8.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06130  hypothetical protein  40.05 
 
 		 388 aa  281  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.187585  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01036  hypothetical protein  40.05 
 
 		 388 aa  281  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479769  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2475  hypothetical protein  39.61 
 
 		 395 aa  281  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.407377  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1930  hypothetical protein  36.93 
 
 		 405 aa  278  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0856188 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1249  hypothetical protein  41.28 
 
 		 374 aa  277  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25813 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2871  hypothetical protein  38.73 
 
 		 388 aa  276  5e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3837  hypothetical protein  39.35 
 
 		 375 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal  0.855927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1425  hypothetical protein  38.85 
 
 		 374 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345024 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19080  hypothetical protein  40.25 
 
 		 374 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1114  protein of unknown function DUF482  39.6 
 
 		 392 aa  273  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.333144 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1347  hypothetical protein  38.73 
 
 		 394 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4050  hypothetical protein  39.35 
 
 		 375 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4543  hypothetical protein  38.48 
 
 		 403 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3841  hypothetical protein  36.36 
 
 		 416 aa  271  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.614644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0702  hypothetical protein  38.15 
 
 		 378 aa  269  7e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2786  hypothetical protein  40.45 
 
 		 381 aa  268  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2105  hypothetical protein  41.01 
 
 		 438 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0896  hypothetical protein  39.13 
 
 		 414 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0790  hypothetical protein  37.91 
 
 		 378 aa  266  5e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0437  hypothetical protein  37.16 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2734  hypothetical protein  38.63 
 
 		 385 aa  265  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2555  hypothetical protein  38.65 
 
 		 414 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0679  hypothetical protein  34.66 
 
 		 374 aa  263  4e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.323848  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1140  hypothetical protein  34.07 
 
 		 394 aa  263  4e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2329  hypothetical protein  38.08 
 
 		 392 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653635  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0252  hypothetical protein  39.04 
 
 		 393 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1865  hypothetical protein  38.37 
 
 		 406 aa  261  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.164344  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2157  hypothetical protein  37.81 
 
 		 455 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.391826  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3005  hypothetical protein  40.96 
 
 		 383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3791  hypothetical protein  39.32 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0943  hypothetical protein  40.86 
 
 		 380 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118065  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3103  hypothetical protein  38.27 
 
 		 376 aa  251  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.73421  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1665  hypothetical protein  36.26 
 
 		 418 aa  250  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.750799  normal  0.0965206 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3548  protein of unknown function DUF482  37.85 
 
 		 409 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1772  protein of unknown function DUF482  36.43 
 
 		 396 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2296  hypothetical protein  35.97 
 
 		 421 aa  249  6e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.124232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2802  hypothetical protein  38.69 
 
 		 398 aa  249  7e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0294833  normal  0.670826 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3885  protein of unknown function DUF482  37.5 
 
 		 411 aa  249  8e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3315  hypothetical protein  38.52 
 
 		 406 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.479503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0745  protein of unknown function DUF482  40.26 
 
 		 413 aa  247  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00828305 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0135  protein of unknown function DUF482  35.51 
 
 		 406 aa  247  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0166  protein of unknown function DUF482  37.65 
 
 		 405 aa  247  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0717665  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1656  hypothetical protein  34.58 
 
 		 433 aa  246  4e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2486  hypothetical protein  36.2 
 
 		 421 aa  246  4e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.954327  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4316  hypothetical protein  37.35 
 
 		 406 aa  246  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2025  hypothetical protein  35.44 
 
 		 405 aa  246  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1575  protein of unknown function DUF482  36.43 
 
 		 396 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.645858  normal  0.365702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4685  protein of unknown function DUF482  37.35 
 
 		 406 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1715  hypothetical protein  36.82 
 
 		 377 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0063  hypothetical protein  36.27 
 
 		 386 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1425  hypothetical protein  37.24 
 
 		 414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.625932  normal  0.472174 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2406  hypothetical protein  38.4 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.688762  normal  0.186145 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2368  hypothetical protein  37.98 
 
 		 398 aa  244  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0181768  normal  0.305905 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>