155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2475 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2475  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  818    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.407377  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0437  hypothetical protein  75.52 
 
 		 387 aa  616  1e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0135  protein of unknown function DUF482  71.36 
 
 		 406 aa  581  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0252  hypothetical protein  71.13 
 
 		 393 aa  571  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0896  hypothetical protein  68.96 
 
 		 414 aa  559  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2555  hypothetical protein  68.7 
 
 		 414 aa  558  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2734  hypothetical protein  61.38 
 
 		 385 aa  492  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1425  hypothetical protein  52.94 
 
 		 414 aa  435  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.625932  normal  0.472174 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2802  hypothetical protein  54.04 
 
 		 398 aa  433  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0294833  normal  0.670826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2322  hypothetical protein  53.59 
 
 		 427 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.483949 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4316  hypothetical protein  52.97 
 
 		 406 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2450  hypothetical protein  52.07 
 
 		 417 aa  426  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.456626  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4685  protein of unknown function DUF482  53.49 
 
 		 406 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3791  hypothetical protein  54.24 
 
 		 390 aa  419  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4833  protein of unknown function DUF482  53.69 
 
 		 406 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261808  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4593  hypothetical protein  53.89 
 
 		 405 aa  411  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3315  hypothetical protein  51.11 
 
 		 406 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.479503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4753  hypothetical protein  50.76 
 
 		 402 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.51971 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2406  hypothetical protein  51.49 
 
 		 411 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.688762  normal  0.186145 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3103  hypothetical protein  54.92 
 
 		 376 aa  403  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.73421  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3548  protein of unknown function DUF482  53.66 
 
 		 409 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1665  hypothetical protein  51.9 
 
 		 418 aa  400  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.750799  normal  0.0965206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3142  hypothetical protein  54.48 
 
 		 386 aa  401  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0531471 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0166  protein of unknown function DUF482  53.11 
 
 		 405 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0717665  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1772  protein of unknown function DUF482  51.81 
 
 		 396 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1575  protein of unknown function DUF482  50.64 
 
 		 396 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.645858  normal  0.365702 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1121  hypothetical protein  51.95 
 
 		 395 aa  396  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2025  hypothetical protein  50.26 
 
 		 405 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1167  hypothetical protein  49.1 
 
 		 395 aa  387  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0877771  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1114  protein of unknown function DUF482  50.25 
 
 		 392 aa  385  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.333144 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1294  hypothetical protein  51.82 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.724983  normal  0.811045 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1124  hypothetical protein  49.1 
 
 		 395 aa  388  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.326303  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2786  hypothetical protein  53.87 
 
 		 381 aa  385  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3045  hypothetical protein  54.39 
 
 		 411 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0745  protein of unknown function DUF482  49.75 
 
 		 413 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00828305 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3005  hypothetical protein  56.5 
 
 		 383 aa  381  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2533  hypothetical protein  50 
 
 		 402 aa  378  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.941945  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1377  hypothetical protein  48.97 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2458  hypothetical protein  51.16 
 
 		 423 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2105  hypothetical protein  50 
 
 		 438 aa  364  2e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0822  hypothetical protein  43.51 
 
 		 390 aa  335  1e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.295229  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3011  hypothetical protein  46.49 
 
 		 392 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1586  hypothetical protein  46.49 
 
 		 392 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215515  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2273  hypothetical protein  46.49 
 
 		 392 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0740  hypothetical protein  46.25 
 
 		 441 aa  328  8e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.391728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1083  hypothetical protein  46.25 
 
 		 441 aa  328  9e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1088  hypothetical protein  46.25 
 
 		 441 aa  328  9e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267189  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1241  hypothetical protein  46.25 
 
 		 464 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0679  hypothetical protein  45.01 
 
 		 400 aa  323  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2417  hypothetical protein  44.44 
 
 		 392 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.673667  normal  0.0190965 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0881  hypothetical protein  45.04 
 
 		 410 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642732  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1801  hypothetical protein  44.7 
 
 		 392 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2413  hypothetical protein  44.7 
 
 		 392 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0877  hypothetical protein  44.7 
 
 		 392 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5740  hypothetical protein  44.3 
 
 		 392 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2323  hypothetical protein  44.44 
 
 		 392 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.471895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3397  hypothetical protein  42.42 
 
 		 389 aa  316  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2170  hypothetical protein  41.71 
 
 		 390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164145  hitchhiker  0.00000155889 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1116  protein of unknown function DUF482  42.17 
 
 		 389 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.492606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2458  hypothetical protein  44.21 
 
 		 374 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0657  hypothetical protein  44.39 
 
 		 373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2359  protein of unknown function DUF482  43.65 
 
 		 393 aa  306  5.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.597494  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1708  hypothetical protein  41.5 
 
 		 418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22410  hypothetical protein  44.7 
 
 		 374 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000252116 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2611  hypothetical protein  44.1 
 
 		 415 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1249  hypothetical protein  45.45 
 
 		 374 aa  299  5e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1425  hypothetical protein  43.19 
 
 		 374 aa  299  6e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345024 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2534  hypothetical protein  42.24 
 
 		 384 aa  299  7e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2348  hypothetical protein  43.22 
 
 		 408 aa  298  9e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291454  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2159  protein of unknown function DUF482  44.27 
 
 		 410 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.296465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2563  protein of unknown function DUF482  43.81 
 
 		 410 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.871216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2114  hypothetical protein  43.3 
 
 		 391 aa  295  8e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0393548 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4092  hypothetical protein  42.78 
 
 		 375 aa  295  9e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3828  hypothetical protein  43 
 
 		 375 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210412  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0804  hypothetical protein  42.75 
 
 		 402 aa  295  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3837  hypothetical protein  43.27 
 
 		 375 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal  0.855927 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1758  protein of unknown function DUF482  42.68 
 
 		 426 aa  293  4e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3121  hypothetical protein  42.21 
 
 		 438 aa  292  8e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1715  hypothetical protein  42.97 
 
 		 377 aa  291  1e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4050  hypothetical protein  43.16 
 
 		 375 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4543  hypothetical protein  42.48 
 
 		 403 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1896  hypothetical protein  45.22 
 
 		 374 aa  289  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1347  hypothetical protein  42.48 
 
 		 394 aa  288  9e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3017  hypothetical protein  39.9 
 
 		 384 aa  288  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2007  protein of unknown function DUF482  40.26 
 
 		 392 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1140  hypothetical protein  37.85 
 
 		 394 aa  285  7e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19080  hypothetical protein  44.44 
 
 		 374 aa  285  9e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1760  hypothetical protein  39.85 
 
 		 406 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4876  hypothetical protein  39.61 
 
 		 407 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1962  protein of unknown function DUF482  39.85 
 
 		 456 aa  280  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.846465  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0114  hypothetical protein  38.19 
 
 		 421 aa  279  7e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139598  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2969  hypothetical protein  42.59 
 
 		 381 aa  278  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0063  hypothetical protein  41.94 
 
 		 386 aa  278  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1444  protein of unknown function DUF482  39.9 
 
 		 411 aa  276  4e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2871  hypothetical protein  38.7 
 
 		 388 aa  276  4e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3885  protein of unknown function DUF482  41.09 
 
 		 411 aa  276  5e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1930  hypothetical protein  37.62 
 
 		 405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0856188 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1736  hypothetical protein  38.44 
 
 		 414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.327747 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0790  hypothetical protein  38.5 
 
 		 378 aa  264  2e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3841  hypothetical protein  37.59 
 
 		 416 aa  263  4e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.614644  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>