150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2085 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2085  hypothetical protein  100 
 
 
446 aa  939    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.817202  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0316  hypothetical protein  57.17 
 
 
445 aa  545  1e-154  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0288  hypothetical protein  56.38 
 
 
450 aa  543  1e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0063  hypothetical protein  38.43 
 
 
386 aa  289  9e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405281  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1656  hypothetical protein  36.91 
 
 
433 aa  271  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0679  hypothetical protein  36.47 
 
 
374 aa  268  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.323848  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3397  hypothetical protein  38.59 
 
 
389 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6252  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3841  hypothetical protein  38.18 
 
 
416 aa  267  2.9999999999999995e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.614644  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1116  protein of unknown function DUF482  38.59 
 
 
389 aa  266  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.492606  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2871  hypothetical protein  37.24 
 
 
388 aa  266  4e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2170  hypothetical protein  37.41 
 
 
390 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164145  hitchhiker  0.00000155889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1896  hypothetical protein  37.41 
 
 
374 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22410  hypothetical protein  37.41 
 
 
374 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000252116 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1865  hypothetical protein  36.28 
 
 
406 aa  263  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.164344  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2329  hypothetical protein  38.15 
 
 
392 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653635  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1930  hypothetical protein  35.12 
 
 
405 aa  262  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0856188 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4092  hypothetical protein  36.78 
 
 
375 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3828  hypothetical protein  36.12 
 
 
375 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210412  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1249  hypothetical protein  37.89 
 
 
374 aa  260  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25813 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1241  hypothetical protein  37.18 
 
 
464 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1083  hypothetical protein  37.18 
 
 
441 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1088  hypothetical protein  37.18 
 
 
441 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267189  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0740  hypothetical protein  37.18 
 
 
441 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.391728  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3011  hypothetical protein  36.71 
 
 
392 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1586  hypothetical protein  36.71 
 
 
392 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215515  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2157  hypothetical protein  35.81 
 
 
455 aa  256  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.391826  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2273  hypothetical protein  36.71 
 
 
392 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2348  hypothetical protein  34.92 
 
 
408 aa  256  7e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291454  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0679  hypothetical protein  36.26 
 
 
400 aa  256  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0657  hypothetical protein  35.75 
 
 
373 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2296  hypothetical protein  35.78 
 
 
421 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.124232  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4316  hypothetical protein  36.75 
 
 
406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19080  hypothetical protein  36.63 
 
 
374 aa  254  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0881  hypothetical protein  36.71 
 
 
410 aa  254  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642732  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4050  hypothetical protein  35.37 
 
 
375 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2486  hypothetical protein  35.45 
 
 
421 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.954327  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3121  hypothetical protein  35.42 
 
 
438 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4593  hypothetical protein  35.12 
 
 
405 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2368  hypothetical protein  35.68 
 
 
398 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0181768  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4685  protein of unknown function DUF482  36.5 
 
 
406 aa  252  7e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3312  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1758  protein of unknown function DUF482  36.43 
 
 
426 aa  252  8.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2458  hypothetical protein  37.65 
 
 
374 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4543  hypothetical protein  33.79 
 
 
403 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3837  hypothetical protein  35.37 
 
 
375 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal  0.855927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1347  hypothetical protein  33.56 
 
 
394 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2611  hypothetical protein  36.24 
 
 
415 aa  250  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2323  hypothetical protein  37.65 
 
 
392 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.471895  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3017  hypothetical protein  34.87 
 
 
384 aa  249  9e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0877  hypothetical protein  36.71 
 
 
392 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1760  hypothetical protein  35.1 
 
 
406 aa  248  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2114  hypothetical protein  34.72 
 
 
391 aa  247  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0393548 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1962  protein of unknown function DUF482  35.1 
 
 
456 aa  248  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.846465  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2359  protein of unknown function DUF482  35.45 
 
 
393 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.597494  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1425  hypothetical protein  35.24 
 
 
374 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.345024 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2159  protein of unknown function DUF482  35.06 
 
 
410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.296465  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0822  hypothetical protein  34.67 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.295229  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4876  hypothetical protein  35.75 
 
 
407 aa  244  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239884  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1444  protein of unknown function DUF482  34.36 
 
 
411 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4833  protein of unknown function DUF482  35.11 
 
 
406 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261808  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2563  protein of unknown function DUF482  34.81 
 
 
410 aa  243  7e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.871216  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1140  hypothetical protein  33.01 
 
 
394 aa  242  7.999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1801  hypothetical protein  36.47 
 
 
392 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2413  hypothetical protein  36.47 
 
 
392 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2308  hypothetical protein  33.33 
 
 
451 aa  242  9e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0870816  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0166  protein of unknown function DUF482  33.96 
 
 
405 aa  242  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0717665  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2475  hypothetical protein  36.41 
 
 
395 aa  241  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.407377  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2417  hypothetical protein  36.24 
 
 
392 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.673667  normal  0.0190965 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02848  hypothetical protein  34 
 
 
445 aa  241  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.29586  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0114  hypothetical protein  34.66 
 
 
421 aa  240  4e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139598  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2322  hypothetical protein  33.97 
 
 
427 aa  240  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.483949 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5740  hypothetical protein  36.24 
 
 
392 aa  239  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1953  hypothetical protein  34.51 
 
 
432 aa  238  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0943  hypothetical protein  36.74 
 
 
380 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118065  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2007  protein of unknown function DUF482  33.49 
 
 
392 aa  239  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0804  hypothetical protein  36.63 
 
 
402 aa  238  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1793  hypothetical protein  33.96 
 
 
382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426104  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2802  hypothetical protein  33.89 
 
 
398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0294833  normal  0.670826 
 
 
-
 
NC_004310  BR1167  hypothetical protein  34.05 
 
 
395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0877771  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1665  hypothetical protein  35.59 
 
 
418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.750799  normal  0.0965206 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1708  hypothetical protein  34.08 
 
 
418 aa  234  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1124  hypothetical protein  34.05 
 
 
395 aa  234  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.326303  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2969  hypothetical protein  34.78 
 
 
381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1728  protein of unknown function DUF482  32.7 
 
 
470 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0347307  normal  0.0114903 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3548  protein of unknown function DUF482  32.94 
 
 
409 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2025  hypothetical protein  32.24 
 
 
405 aa  230  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1294  hypothetical protein  33.49 
 
 
393 aa  229  7e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.724983  normal  0.811045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2657  hypothetical protein  32.56 
 
 
470 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00609498  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2619  hypothetical protein  32.7 
 
 
470 aa  229  9e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2534  hypothetical protein  32.7 
 
 
384 aa  228  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1736  hypothetical protein  33.11 
 
 
414 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.327747 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1668  hypothetical protein  35.22 
 
 
427 aa  228  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0437  hypothetical protein  33.17 
 
 
387 aa  226  9e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2406  hypothetical protein  32.53 
 
 
411 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.688762  normal  0.186145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3315  hypothetical protein  32.53 
 
 
406 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.479503  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3045  hypothetical protein  32.85 
 
 
411 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3885  protein of unknown function DUF482  34.52 
 
 
411 aa  223  7e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854025  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2458  hypothetical protein  31.98 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06130  hypothetical protein  31.97 
 
 
388 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.187585  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01036  hypothetical protein  31.97 
 
 
388 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479769  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2732  hypothetical protein  32.28 
 
 
470 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.96402  normal  0.438738 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>