150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0908 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0908  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  769    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4569  hypothetical protein  35.28 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0804  hypothetical protein  35 
 
 		 391 aa  216  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1187  hypothetical protein  36.06 
 
 		 391 aa  213  5.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.225085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0543  protein of unknown function DUF482  34.96 
 
 		 395 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0560  protein of unknown function DUF482  34.96 
 
 		 395 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3564  protein of unknown function DUF482  35.38 
 
 		 391 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.221346 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01201  hypothetical protein  34.12 
 
 		 390 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.640897  normal  0.481871 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1577  protein of unknown function DUF482  33.52 
 
 		 396 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.187748 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0350  hypothetical protein  34.52 
 
 		 391 aa  192  8e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0108  hypothetical protein  32.29 
 
 		 384 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.139955  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01201  hypothetical protein  31.25 
 
 		 384 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0133  protein of unknown function DUF482  33.24 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00342506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2871  hypothetical protein  33.24 
 
 		 388 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01211  hypothetical protein  31.41 
 
 		 384 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02101  hypothetical protein  34.75 
 
 		 378 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2786  hypothetical protein  36.36 
 
 		 381 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1140  hypothetical protein  29.74 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2342  hypothetical protein  34.42 
 
 		 391 aa  179  8e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3017  hypothetical protein  29.67 
 
 		 384 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4092  hypothetical protein  32.35 
 
 		 375 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3828  hypothetical protein  31.86 
 
 		 375 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210412  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4685  protein of unknown function DUF482  33.33 
 
 		 406 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1425  hypothetical protein  31.46 
 
 		 374 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345024 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4833  protein of unknown function DUF482  33.63 
 
 		 406 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261808  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4316  hypothetical protein  33.04 
 
 		 406 aa  168  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0822  hypothetical protein  30.31 
 
 		 390 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.295229  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2157  hypothetical protein  30.52 
 
 		 455 aa  166  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.391826  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01171  hypothetical protein  28.88 
 
 		 388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.173885  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3548  protein of unknown function DUF482  32.94 
 
 		 409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2322  hypothetical protein  31.52 
 
 		 427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.483949 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1865  hypothetical protein  29.22 
 
 		 406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.164344  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4593  hypothetical protein  33.05 
 
 		 405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0063  hypothetical protein  30.06 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1656  hypothetical protein  29.04 
 
 		 433 aa  164  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4050  hypothetical protein  33.15 
 
 		 375 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0679  hypothetical protein  28.17 
 
 		 374 aa  163  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.323848  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2734  hypothetical protein  33.14 
 
 		 385 aa  162  8.000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4543  hypothetical protein  32.61 
 
 		 403 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3837  hypothetical protein  32.33 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal  0.855927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1347  hypothetical protein  32.61 
 
 		 394 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1114  protein of unknown function DUF482  31.62 
 
 		 392 aa  161  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.333144 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1473  hypothetical protein  29.89 
 
 		 393 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1377  hypothetical protein  32.46 
 
 		 397 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1249  hypothetical protein  31.27 
 
 		 374 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25813 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5740  hypothetical protein  32.09 
 
 		 392 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3103  hypothetical protein  33.43 
 
 		 376 aa  160  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.73421  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19080  hypothetical protein  31.44 
 
 		 374 aa  160  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01761  hypothetical protein  29.89 
 
 		 393 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.46624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1444  protein of unknown function DUF482  31.86 
 
 		 411 aa  159  5e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2406  hypothetical protein  33.33 
 
 		 411 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.688762  normal  0.186145 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0804  hypothetical protein  31.11 
 
 		 402 aa  159  8e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2534  hypothetical protein  30.77 
 
 		 384 aa  158  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0657  hypothetical protein  31.58 
 
 		 373 aa  158  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1930  hypothetical protein  27.72 
 
 		 405 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0856188 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2348  hypothetical protein  32.11 
 
 		 408 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291454  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2417  hypothetical protein  32.09 
 
 		 392 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.673667  normal  0.0190965 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2563  protein of unknown function DUF482  31.3 
 
 		 410 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.871216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2450  hypothetical protein  31.48 
 
 		 417 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.456626  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1294  hypothetical protein  32.59 
 
 		 393 aa  158  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.724983  normal  0.811045 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2007  protein of unknown function DUF482  31.18 
 
 		 392 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0881  hypothetical protein  30.86 
 
 		 410 aa  157  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642732  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0877  hypothetical protein  32.38 
 
 		 392 aa  156  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2323  hypothetical protein  32.09 
 
 		 392 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.471895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2273  hypothetical protein  30.29 
 
 		 392 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3011  hypothetical protein  30.29 
 
 		 392 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1586  hypothetical protein  30.29 
 
 		 392 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215515  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0740  hypothetical protein  30.29 
 
 		 441 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.391728  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2475  hypothetical protein  31.34 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.407377  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0166  protein of unknown function DUF482  34.26 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0717665  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0437  hypothetical protein  30.25 
 
 		 387 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3315  hypothetical protein  32.93 
 
 		 406 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.479503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3045  hypothetical protein  33.33 
 
 		 411 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1801  hypothetical protein  31.81 
 
 		 392 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2413  hypothetical protein  31.81 
 
 		 392 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1083  hypothetical protein  30 
 
 		 441 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1088  hypothetical protein  30 
 
 		 441 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267189  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1121  hypothetical protein  31.02 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2170  hypothetical protein  29.15 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164145  hitchhiker  0.00000155889 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1241  hypothetical protein  30 
 
 		 464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4753  hypothetical protein  31.72 
 
 		 402 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.51971 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1425  hypothetical protein  31.67 
 
 		 414 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.625932  normal  0.472174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22410  hypothetical protein  31.36 
 
 		 374 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000252116 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1116  protein of unknown function DUF482  29.74 
 
 		 389 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.492606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2159  protein of unknown function DUF482  31.3 
 
 		 410 aa  152  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.296465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2359  protein of unknown function DUF482  32.38 
 
 		 393 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.597494  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3397  hypothetical protein  29.45 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3791  hypothetical protein  32.97 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2105  hypothetical protein  33.53 
 
 		 438 aa  149  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1167  hypothetical protein  30.15 
 
 		 395 aa  149  7e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0877771  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3005  hypothetical protein  33.89 
 
 		 383 aa  149  8e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1760  hypothetical protein  30.37 
 
 		 406 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1896  hypothetical protein  32.41 
 
 		 374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1715  hypothetical protein  33.72 
 
 		 377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0114  hypothetical protein  31.72 
 
 		 421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139598  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3841  hypothetical protein  29.44 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.614644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2969  hypothetical protein  32.52 
 
 		 381 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2329  hypothetical protein  29.63 
 
 		 392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653635  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3500  protein of unknown function DUF482  32.29 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1124  hypothetical protein  29.85 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.326303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>