152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0108 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0108  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  783    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.139955  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01211  hypothetical protein  93.75 
 
 
384 aa  739    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01201  hypothetical protein  93.49 
 
 
384 aa  737    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01171  hypothetical protein  77.86 
 
 
388 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.173885  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2342  hypothetical protein  50.94 
 
 
391 aa  422  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1473  hypothetical protein  52.63 
 
 
393 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0350  hypothetical protein  49.6 
 
 
391 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01201  hypothetical protein  52.14 
 
 
390 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.640897  normal  0.481871 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01761  hypothetical protein  52.37 
 
 
393 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.46624  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02101  hypothetical protein  48.22 
 
 
378 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1187  hypothetical protein  45.82 
 
 
391 aa  381  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.225085  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0804  hypothetical protein  43.28 
 
 
391 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0543  protein of unknown function DUF482  43.01 
 
 
395 aa  362  6e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0560  protein of unknown function DUF482  43.01 
 
 
395 aa  362  6e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4569  hypothetical protein  43.01 
 
 
403 aa  360  3e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3564  protein of unknown function DUF482  41.55 
 
 
391 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.221346 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1577  protein of unknown function DUF482  41.4 
 
 
396 aa  349  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.187748 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0133  protein of unknown function DUF482  36 
 
 
403 aa  295  7e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00342506  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3017  hypothetical protein  35.87 
 
 
384 aa  230  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2322  hypothetical protein  31.52 
 
 
427 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.483949 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0437  hypothetical protein  30.89 
 
 
387 aa  206  6e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0822  hypothetical protein  31.15 
 
 
390 aa  203  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.295229  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4753  hypothetical protein  30.1 
 
 
402 aa  203  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.51971 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2114  hypothetical protein  29.85 
 
 
391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0393548 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2475  hypothetical protein  30.95 
 
 
395 aa  200  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.407377  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3885  protein of unknown function DUF482  28.61 
 
 
411 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854025  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3841  hypothetical protein  30.93 
 
 
416 aa  200  3.9999999999999996e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.614644  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3315  hypothetical protein  30.79 
 
 
406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.479503  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2734  hypothetical protein  30.42 
 
 
385 aa  199  7.999999999999999e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1425  hypothetical protein  28.46 
 
 
414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.625932  normal  0.472174 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2450  hypothetical protein  29.59 
 
 
417 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.456626  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2157  hypothetical protein  28.94 
 
 
455 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.391826  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3045  hypothetical protein  31.75 
 
 
411 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2329  hypothetical protein  29.61 
 
 
392 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653635  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3548  protein of unknown function DUF482  31.87 
 
 
409 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2007  protein of unknown function DUF482  28.81 
 
 
392 aa  196  7e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4316  hypothetical protein  31.01 
 
 
406 aa  196  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1865  hypothetical protein  30.17 
 
 
406 aa  195  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.164344  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0135  protein of unknown function DUF482  28.83 
 
 
406 aa  195  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4685  protein of unknown function DUF482  30.73 
 
 
406 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3312  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1444  protein of unknown function DUF482  30.79 
 
 
411 aa  193  6e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1294  hypothetical protein  28.87 
 
 
393 aa  192  8e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.724983  normal  0.811045 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1930  protein of unknown function DUF482  29.53 
 
 
374 aa  192  8e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.207995 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0679  hypothetical protein  35.43 
 
 
374 aa  192  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.323848  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1140  hypothetical protein  30.51 
 
 
394 aa  191  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2406  hypothetical protein  30.36 
 
 
411 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.688762  normal  0.186145 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0252  hypothetical protein  29.61 
 
 
393 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0908  hypothetical protein  32.29 
 
 
373 aa  189  5.999999999999999e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562681  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0896  hypothetical protein  29.23 
 
 
414 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2802  hypothetical protein  28.87 
 
 
398 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0294833  normal  0.670826 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2105  hypothetical protein  29.44 
 
 
438 aa  187  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0657  hypothetical protein  29.77 
 
 
373 aa  186  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1930  hypothetical protein  28.75 
 
 
405 aa  186  8e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0856188 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2555  hypothetical protein  28.46 
 
 
414 aa  186  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2534  hypothetical protein  29.02 
 
 
384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2871  hypothetical protein  30.71 
 
 
388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1656  hypothetical protein  29.25 
 
 
433 aa  184  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4593  hypothetical protein  28.68 
 
 
405 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2969  hypothetical protein  29.37 
 
 
381 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4833  protein of unknown function DUF482  28.32 
 
 
406 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261808  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13710  predicted protein  32.76 
 
 
350 aa  181  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06130  hypothetical protein  29.33 
 
 
388 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.187585  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01036  hypothetical protein  29.33 
 
 
388 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479769  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1114  protein of unknown function DUF482  27.97 
 
 
392 aa  179  7e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.333144 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2458  hypothetical protein  28.16 
 
 
423 aa  179  9e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4092  hypothetical protein  27.11 
 
 
375 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1377  hypothetical protein  27.51 
 
 
397 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2085  hypothetical protein  29.05 
 
 
446 aa  178  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.817202  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1116  protein of unknown function DUF482  28.57 
 
 
389 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.492606  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0804  hypothetical protein  29.46 
 
 
402 aa  177  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2025  hypothetical protein  28.46 
 
 
405 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2359  protein of unknown function DUF482  27.04 
 
 
393 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.597494  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3397  hypothetical protein  28.57 
 
 
389 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6252  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0063  hypothetical protein  32.31 
 
 
386 aa  177  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405281  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4543  hypothetical protein  26.6 
 
 
403 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5740  hypothetical protein  29.13 
 
 
392 aa  176  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0166  protein of unknown function DUF482  27.98 
 
 
405 aa  176  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0717665  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3103  hypothetical protein  29.87 
 
 
376 aa  175  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.73421  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4050  hypothetical protein  26.33 
 
 
375 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0288  hypothetical protein  27.76 
 
 
450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1347  hypothetical protein  26.33 
 
 
394 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2417  hypothetical protein  28.35 
 
 
392 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.673667  normal  0.0190965 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3837  hypothetical protein  26.54 
 
 
375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal  0.855927 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0702  hypothetical protein  30.55 
 
 
378 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1665  hypothetical protein  32.49 
 
 
418 aa  173  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.750799  normal  0.0965206 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3828  hypothetical protein  26.84 
 
 
375 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210412  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0943  hypothetical protein  30.7 
 
 
380 aa  173  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118065  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1425  hypothetical protein  28.94 
 
 
374 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.345024 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1708  hypothetical protein  27.03 
 
 
418 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2323  hypothetical protein  28.28 
 
 
392 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.471895  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0790  hypothetical protein  30.55 
 
 
378 aa  172  7.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2533  hypothetical protein  26.79 
 
 
402 aa  172  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.941945  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3791  hypothetical protein  27.56 
 
 
390 aa  172  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1801  hypothetical protein  27.76 
 
 
392 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2413  hypothetical protein  27.76 
 
 
392 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3005  hypothetical protein  29.69 
 
 
383 aa  170  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3481  hypothetical protein  26.63 
 
 
388 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.334127 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2170  hypothetical protein  28 
 
 
390 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164145  hitchhiker  0.00000155889 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1715  hypothetical protein  28.91 
 
 
377 aa  169  7e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1124  hypothetical protein  27.57 
 
 
395 aa  169  9e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.326303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>