41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2696 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2696  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
311 aa  623  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  37 
 
 
355 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0961  glycosyl transferase, group 1  36.94 
 
 
358 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1016  glycosyl transferase, group 1  36.22 
 
 
689 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1074  glycosyl transferase group 1  36.99 
 
 
690 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1077  glycosyl transferase group 1  36.89 
 
 
690 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.383593  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2360  cellulose biosynthesis protein CelD  30.27 
 
 
382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1950  hypothetical protein  29.39 
 
 
390 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0965898  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.9 
 
 
368 aa  83.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3993  Tetratricopeptide domain protein  26.3 
 
 
550 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4322  Tetratricopeptide domain protein  25.84 
 
 
550 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.576139 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0964  TPR and WD-40 repeat-containing protein  26.92 
 
 
506 aa  73.9  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.907164 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.28 
 
 
393 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1959  hypothetical protein  29.38 
 
 
336 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.28 
 
 
393 aa  72.4  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0891  hypothetical protein  25.08 
 
 
329 aa  72.4  0.000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.27 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  37.04 
 
 
392 aa  69.3  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1003  hypothetical protein  30.56 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.305983  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_875  hypothetical protein  24.57 
 
 
329 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25 
 
 
359 aa  62.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2464  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  24.92 
 
 
377 aa  59.3  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5827  cellulose biosynthesis protein CelD  24.77 
 
 
397 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.297647  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1117  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like  27.43 
 
 
477 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.362089  normal  0.897586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3884  hypothetical protein  23.83 
 
 
420 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1625  hypothetical protein  29.81 
 
 
373 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.370324  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2698  hypothetical protein  24.78 
 
 
400 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.402222  normal  0.567569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1797  hypothetical protein  27.25 
 
 
389 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07781  cellulose biosynthesis protein CelD  21.17 
 
 
386 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0132299 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3241  hypothetical protein  26.58 
 
 
311 aa  46.6  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2995  hypothetical protein  22.22 
 
 
437 aa  46.6  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1327  hypothetical protein  22.89 
 
 
347 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0362501 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0432  cellulose biosynthesis protein CelD  24.53 
 
 
374 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05290  hypothetical protein  28.41 
 
 
379 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0316409  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1922  hypothetical protein  25.4 
 
 
355 aa  45.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.26263  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5313  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.21 
 
 
386 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323377  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  24.31 
 
 
346 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0159  hypothetical protein  26.09 
 
 
370 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3221  hypothetical protein  23.15 
 
 
395 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.978135  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1556  cellulose biosynthesis protein CelD  26.09 
 
 
378 aa  43.1  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2339  hypothetical protein  24.74 
 
 
334 aa  43.1  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>