59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1922 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1922  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  713    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.26263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4037  hypothetical protein  60.23 
 
 		 349 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.493535  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2330  hypothetical protein  57.58 
 
 		 351 aa  360  2e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1528  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  45.03 
 
 		 353 aa  262  6e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  42.9 
 
 		 352 aa  261  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  42.18 
 
 		 343 aa  261  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  45.13 
 
 		 346 aa  257  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0665  hypothetical protein  41.67 
 
 		 345 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0449506  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3113  hypothetical protein  44.77 
 
 		 345 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  40.97 
 
 		 356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  39.17 
 
 		 361 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2404  hypothetical protein  41.84 
 
 		 344 aa  242  6e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0288  hypothetical protein  42.22 
 
 		 354 aa  241  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  42.34 
 
 		 350 aa  232  7.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  40.12 
 
 		 347 aa  229  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  36.78 
 
 		 344 aa  199  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  32.05 
 
 		 344 aa  190  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  34.72 
 
 		 344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  33.33 
 
 		 344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  36.69 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  34.23 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  34.23 
 
 		 348 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0138  hypothetical protein  30.56 
 
 		 471 aa  166  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  32.54 
 
 		 368 aa  159  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  26.5 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  26.11 
 
 		 349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  29.65 
 
 		 346 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01304  hypothetical protein  24.56 
 
 		 357 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  23.49 
 
 		 369 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  23.94 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  24.42 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  30.88 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0719  hypothetical protein  23.05 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00617075  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  20.29 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  22.51 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0881  hypothetical protein  26.99 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642732  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2273  hypothetical protein  26.44 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0740  hypothetical protein  26.44 
 
 		 441 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.391728  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3011  hypothetical protein  26.44 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350718  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1083  hypothetical protein  26.44 
 
 		 441 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1241  hypothetical protein  26.44 
 
 		 464 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1088  hypothetical protein  26.44 
 
 		 441 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267189  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1586  hypothetical protein  26.44 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215515  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  33.49 
 
 		 368 aa  53.9  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3397  hypothetical protein  24.93 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  22.84 
 
 		 354 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  24.3 
 
 		 366 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1294  hypothetical protein  24.16 
 
 		 393 aa  50.4  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.724983  normal  0.811045 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2323  hypothetical protein  26.76 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.471895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1116  protein of unknown function DUF482  24.42 
 
 		 389 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.492606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  24.11 
 
 		 360 aa  47  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  22.22 
 
 		 347 aa  46.6  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  25.09 
 
 		 332 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2696  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0877  hypothetical protein  26.39 
 
 		 392 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2170  hypothetical protein  24.65 
 
 		 390 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164145  hitchhiker  0.00000155889 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  23.08 
 
 		 372 aa  43.5  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2458  hypothetical protein  25.29 
 
 		 374 aa  43.5  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5740  hypothetical protein  25.59 
 
 		 392 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>