20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1327 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1327  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  709    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0362501 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0468  hypothetical protein  74.31 
 
 
333 aa  487  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1113  hypothetical protein  23.03 
 
 
335 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3173  hypothetical protein  26.82 
 
 
334 aa  62  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.298047 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0767  hypothetical protein  27.24 
 
 
308 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2314  hypothetical protein  25.23 
 
 
338 aa  56.6  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  26.18 
 
 
335 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1880  hypothetical protein  27.27 
 
 
309 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3432  hypothetical protein  22.56 
 
 
339 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  31.33 
 
 
332 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  26.83 
 
 
363 aa  47  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  24.2 
 
 
370 aa  47  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  26.98 
 
 
366 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1059  hypothetical protein  28.95 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0735999  normal  0.223268 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2696  glycosyl transferase, group 1  22.89 
 
 
311 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  25.28 
 
 
366 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5010  femAB family protein  25.86 
 
 
341 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.342142  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  27.16 
 
 
360 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2396  hypothetical protein  28.95 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.359759  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2312  hypothetical protein  23.56 
 
 
343 aa  43.5  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>