18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1880 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1880  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3432  hypothetical protein  26.94 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1831  hypothetical protein  25.7 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3044  hypothetical protein  28.49 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5112  hypothetical protein  24.78 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0964659  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2314  hypothetical protein  30.53 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0468  hypothetical protein  28.32 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1327  hypothetical protein  27.27 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0362501 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1337  hypothetical protein  29.23 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3442  hypothetical protein  25.37 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.768278  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2313  hypothetical protein  25.35 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2500  hypothetical protein  28.22 
 
 		 350 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2312  hypothetical protein  26.44 
 
 		 343 aa  53.5  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1113  hypothetical protein  22.17 
 
 		 335 aa  49.7  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  25.45 
 
 		 332 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  25.67 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0882  hypothetical protein  27.78 
 
 		 309 aa  46.2  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.92764 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0767  hypothetical protein  22.85 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.226226 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>