15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0767 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0767  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  642    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_002950  PG0882  hypothetical protein  32.52 
 
 
309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.92764 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2396  hypothetical protein  29.61 
 
 
333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.359759  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1059  hypothetical protein  30.5 
 
 
333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0735999  normal  0.223268 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2763  hypothetical protein  27.62 
 
 
324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3173  hypothetical protein  24.58 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.298047 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  24.84 
 
 
332 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1327  hypothetical protein  27.24 
 
 
347 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0362501 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  23.2 
 
 
335 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1831  hypothetical protein  21.37 
 
 
339 aa  50.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0468  hypothetical protein  29.19 
 
 
333 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0002  hypothetical protein  23.44 
 
 
332 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00618291  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1113  hypothetical protein  20.83 
 
 
335 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3349  hypothetical protein  28.22 
 
 
364 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  24.62 
 
 
346 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>