16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0468 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0468  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  684    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1327  hypothetical protein  74.31 
 
 		 347 aa  499  1e-140  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0362501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1113  hypothetical protein  23.97 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  28.48 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3173  hypothetical protein  28.41 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.298047 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1880  hypothetical protein  28.32 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2314  hypothetical protein  24.23 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3432  hypothetical protein  25.56 
 
 		 339 aa  53.5  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0767  hypothetical protein  29.19 
 
 		 308 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5010  femAB family protein  27.75 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.342142  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2312  hypothetical protein  24.23 
 
 		 343 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2313  hypothetical protein  22.26 
 
 		 342 aa  50.4  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1185  methicillin resistance protein  29.2 
 
 		 315 aa  47  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.192582  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  25.44 
 
 		 360 aa  46.2  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  30.92 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  24.84 
 
 		 380 aa  43.9  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>