29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_5010 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_5010  femAB family protein  100 
 
 		 341 aa  699    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.342142  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  26.15 
 
 		 370 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  25.32 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0719  hypothetical protein  23.03 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00617075  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  27.03 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  23.81 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  23.74 
 
 		 340 aa  51.2  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  30.58 
 
 		 346 aa  50.1  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  24.1 
 
 		 346 aa  49.7  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  22.22 
 
 		 368 aa  49.3  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0947  femB protein  25.45 
 
 		 417 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.453149  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  23.2 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  22.04 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0886  Methicillin resistance protein  25.97 
 
 		 437 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0468  hypothetical protein  27.75 
 
 		 333 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  22.26 
 
 		 347 aa  46.6  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1327  hypothetical protein  25.86 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0362501 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  23.12 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  20.1 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1465  methicillin resistance protein  26.06 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.109752  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1332  methicillin resistance protein  36.36 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0318895  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1436  methicillin resistance protein  26.06 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.250722  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1307  methicillin resistance protein  36.36 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  21.78 
 
 		 332 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  24.05 
 
 		 345 aa  44.3  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0961  hypothetical protein  19.82 
 
 		 372 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.605405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  22.62 
 
 		 348 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  20.8 
 
 		 352 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  21.97 
 
 		 369 aa  42.7  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>