30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2312 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2312  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  708    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2313  hypothetical protein  52.34 
 
 
342 aa  387  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1337  hypothetical protein  50.44 
 
 
342 aa  385  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2314  hypothetical protein  53.73 
 
 
338 aa  377  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1831  hypothetical protein  27.99 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3442  hypothetical protein  27.27 
 
 
338 aa  109  9.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.768278  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2500  hypothetical protein  27.99 
 
 
350 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3044  hypothetical protein  25.24 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  25.96 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3432  hypothetical protein  25.29 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3173  hypothetical protein  26.89 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.298047 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5112  hypothetical protein  25.16 
 
 
336 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0964659  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1113  hypothetical protein  27.62 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  23.41 
 
 
348 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  22.81 
 
 
348 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  24.01 
 
 
332 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  23.51 
 
 
344 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1880  hypothetical protein  26.44 
 
 
309 aa  50.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  22.98 
 
 
344 aa  51.2  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  25.81 
 
 
342 aa  50.1  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  22.62 
 
 
344 aa  49.7  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0468  hypothetical protein  27.37 
 
 
333 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0719  hypothetical protein  23.12 
 
 
333 aa  47.8  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00617075  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  23.29 
 
 
344 aa  46.2  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  26.6 
 
 
370 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  22.54 
 
 
361 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  22.55 
 
 
368 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1327  hypothetical protein  23.56 
 
 
347 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0362501 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  24.13 
 
 
356 aa  42.7  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  28.69 
 
 
350 aa  42.7  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>