52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2511 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  100 
 
 		 356 aa  738    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  69.94 
 
 		 350 aa  487  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  62.82 
 
 		 361 aa  475  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0288  hypothetical protein  64.72 
 
 		 354 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  61 
 
 		 343 aa  431  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  57.73 
 
 		 352 aa  413  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2404  hypothetical protein  55.81 
 
 		 344 aa  395  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  57.73 
 
 		 353 aa  395  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0665  hypothetical protein  55.52 
 
 		 345 aa  393  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0449506  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  51.74 
 
 		 346 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  48.52 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3113  hypothetical protein  50.15 
 
 		 345 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4037  hypothetical protein  42 
 
 		 349 aa  252  7e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.493535  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1922  hypothetical protein  40.97 
 
 		 355 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.26263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  38.14 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2330  hypothetical protein  43.03 
 
 		 351 aa  233  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1528  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  34.8 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  33.14 
 
 		 344 aa  211  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  33.72 
 
 		 344 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  34.81 
 
 		 348 aa  210  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  33.94 
 
 		 342 aa  209  6e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  33.72 
 
 		 348 aa  207  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  33.62 
 
 		 368 aa  203  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  29.73 
 
 		 349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0138  hypothetical protein  26.86 
 
 		 471 aa  159  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  26.17 
 
 		 355 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01304  hypothetical protein  25.07 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  26.35 
 
 		 370 aa  106  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  24.29 
 
 		 346 aa  103  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  23.19 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  23.14 
 
 		 380 aa  95.5  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  24.75 
 
 		 369 aa  92.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  25.57 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2728  protein of unknown function DUF482  23.8 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  24.74 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  22.97 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2501  hypothetical protein  21.05 
 
 		 353 aa  54.3  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2314  hypothetical protein  23.3 
 
 		 338 aa  53.1  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  26.32 
 
 		 383 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  22.22 
 
 		 354 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  24.74 
 
 		 335 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  24.09 
 
 		 368 aa  50.1  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  24.83 
 
 		 332 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  23.08 
 
 		 363 aa  49.7  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  20 
 
 		 341 aa  49.7  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1113  hypothetical protein  20.77 
 
 		 335 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0135  protein of unknown function DUF482  27.94 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  20.8 
 
 		 372 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1393  hypothetical protein  22.47 
 
 		 331 aa  43.9  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2313  hypothetical protein  21.28 
 
 		 342 aa  43.5  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  24.85 
 
 		 329 aa  43.1  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2312  hypothetical protein  24.13 
 
 		 343 aa  42.7  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>