75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_3065 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  709    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  76.15 
 
 
348 aa  552  1e-156  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  52.12 
 
 
344 aa  358  7e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  52.12 
 
 
344 aa  349  4e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  48.99 
 
 
344 aa  344  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  50.6 
 
 
344 aa  344  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  52.11 
 
 
342 aa  334  1e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  40.54 
 
 
368 aa  263  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0138  hypothetical protein  37.43 
 
 
471 aa  242  7e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233537  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2404  hypothetical protein  34.29 
 
 
344 aa  215  8e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  34.85 
 
 
361 aa  212  7e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  34.81 
 
 
356 aa  210  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0288  hypothetical protein  37.79 
 
 
354 aa  209  5e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0665  hypothetical protein  35.24 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0449506  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  33.72 
 
 
352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  36.61 
 
 
350 aa  199  7e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  34.99 
 
 
346 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  31.69 
 
 
355 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  33.81 
 
 
343 aa  192  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01304  hypothetical protein  32.84 
 
 
357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  33.04 
 
 
347 aa  184  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1922  hypothetical protein  36.69 
 
 
355 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.26263  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4037  hypothetical protein  35.16 
 
 
349 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.493535  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  30.77 
 
 
349 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  31.36 
 
 
353 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3113  hypothetical protein  34.18 
 
 
345 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2330  hypothetical protein  30.91 
 
 
351 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1528  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  28.66 
 
 
346 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  25.72 
 
 
370 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  27.76 
 
 
369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  26 
 
 
380 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  25.28 
 
 
346 aa  97.8  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  24.51 
 
 
346 aa  94  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  29.34 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2312  hypothetical protein  22.81 
 
 
343 aa  63.9  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  26.39 
 
 
332 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2501  hypothetical protein  22.78 
 
 
353 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  22.92 
 
 
347 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  22.41 
 
 
360 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  23.32 
 
 
360 aa  59.7  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  22.91 
 
 
354 aa  57.4  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0275  hypothetical protein  31.13 
 
 
350 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  28.25 
 
 
394 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  25 
 
 
363 aa  54.3  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  26.36 
 
 
368 aa  53.5  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2314  hypothetical protein  19.93 
 
 
338 aa  53.5  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2313  hypothetical protein  21.83 
 
 
342 aa  53.1  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1337  hypothetical protein  20.92 
 
 
342 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  25.45 
 
 
354 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1667  hypothetical protein  26.69 
 
 
404 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2342  hypothetical protein  23.42 
 
 
352 aa  50.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1249  hypothetical protein  24.32 
 
 
374 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25813 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1113  hypothetical protein  23.53 
 
 
335 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2728  protein of unknown function DUF482  23.99 
 
 
360 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  24.31 
 
 
366 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  21.28 
 
 
352 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19080  hypothetical protein  23.34 
 
 
374 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4092  hypothetical protein  22.35 
 
 
375 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0719  hypothetical protein  22.55 
 
 
333 aa  47.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00617075  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5378  GCN5-related N-acetyltransferase  26.2 
 
 
363 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5671  hypothetical protein  26.02 
 
 
293 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.597001  normal  0.0100919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  22.94 
 
 
366 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0715  hypothetical protein  26.87 
 
 
321 aa  47  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.821886  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3828  hypothetical protein  22.46 
 
 
375 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210412  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  24.72 
 
 
370 aa  47  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1138  hypothetical protein  19.17 
 
 
324 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  17.98 
 
 
341 aa  46.2  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  22.39 
 
 
372 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  22.02 
 
 
346 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1399  hypothetical protein  27.39 
 
 
350 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3044  hypothetical protein  20.96 
 
 
340 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5112  hypothetical protein  22.59 
 
 
336 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0964659  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  26.09 
 
 
366 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  21.08 
 
 
339 aa  43.9  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  25.62 
 
 
337 aa  43.5  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>