59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2969 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  693    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  53.18 
 
 
343 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0288  hypothetical protein  53.91 
 
 
354 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  51.74 
 
 
356 aa  338  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  54.01 
 
 
350 aa  335  5e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  49.11 
 
 
361 aa  331  1e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2404  hypothetical protein  51.45 
 
 
344 aa  330  3e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  53.8 
 
 
353 aa  323  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  47.02 
 
 
352 aa  309  4e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0665  hypothetical protein  48.7 
 
 
345 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0449506  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  45.16 
 
 
347 aa  285  7e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4037  hypothetical protein  47.66 
 
 
349 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.493535  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3113  hypothetical protein  46.78 
 
 
345 aa  276  3e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1922  hypothetical protein  45.13 
 
 
355 aa  257  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.26263  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2330  hypothetical protein  45.64 
 
 
351 aa  253  5.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1528  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  35.94 
 
 
344 aa  209  8e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  35.31 
 
 
344 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  34.78 
 
 
344 aa  202  8e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  34.99 
 
 
348 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  35.14 
 
 
344 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  34.13 
 
 
368 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  34.1 
 
 
348 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  34.72 
 
 
342 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0138  hypothetical protein  31.16 
 
 
471 aa  176  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233537  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  27.27 
 
 
349 aa  144  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01304  hypothetical protein  27.14 
 
 
357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  25.89 
 
 
370 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  25.21 
 
 
355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  26.06 
 
 
369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  27.12 
 
 
346 aa  99.4  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  25.42 
 
 
380 aa  98.6  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  24.65 
 
 
346 aa  87  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  23.45 
 
 
346 aa  86.7  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  29.69 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  27.36 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  26.07 
 
 
366 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  22.95 
 
 
366 aa  60.1  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  24.6 
 
 
372 aa  59.7  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  22.37 
 
 
366 aa  59.3  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  17.45 
 
 
341 aa  57.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  21.18 
 
 
363 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2501  hypothetical protein  20.06 
 
 
353 aa  53.5  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  20.39 
 
 
360 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2007  protein of unknown function DUF482  25.56 
 
 
392 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  25.54 
 
 
354 aa  50.4  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5010  femAB family protein  24.1 
 
 
341 aa  49.7  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.342142  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2728  protein of unknown function DUF482  23.4 
 
 
360 aa  49.7  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1831  hypothetical protein  21.51 
 
 
339 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2734  hypothetical protein  23.49 
 
 
385 aa  47.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5112  hypothetical protein  25.58 
 
 
336 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0964659  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1425  hypothetical protein  21.77 
 
 
414 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.625932  normal  0.472174 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2450  hypothetical protein  24.08 
 
 
417 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.456626  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  25 
 
 
347 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1113  hypothetical protein  21.63 
 
 
335 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  25 
 
 
339 aa  43.9  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3044  hypothetical protein  23.86 
 
 
340 aa  43.9  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  23.53 
 
 
368 aa  43.5  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1303  hypothetical protein  18.97 
 
 
312 aa  43.5  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  20.97 
 
 
354 aa  42.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>