63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3193 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  718    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  95.66 
 
 		 346 aa  686    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  40.52 
 
 		 380 aa  271  9e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  34.26 
 
 		 346 aa  175  8e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  28.9 
 
 		 369 aa  142  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  24.5 
 
 		 370 aa  129  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  25.07 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  23.19 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  26.15 
 
 		 344 aa  99.8  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  22.51 
 
 		 350 aa  99  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01304  hypothetical protein  23.76 
 
 		 357 aa  97.4  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  23.23 
 
 		 343 aa  95.5  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0665  hypothetical protein  25.84 
 
 		 345 aa  95.5  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0449506  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2404  hypothetical protein  22.51 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  24.51 
 
 		 348 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  23.58 
 
 		 353 aa  92.4  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  27.73 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  25.94 
 
 		 342 aa  90.5  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  24.58 
 
 		 344 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  21.04 
 
 		 361 aa  87.4  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  24.65 
 
 		 346 aa  87  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  23.26 
 
 		 344 aa  86.3  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0288  hypothetical protein  21.55 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  25.61 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  23.75 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  29.41 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  22.9 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1922  hypothetical protein  23.94 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.26263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4037  hypothetical protein  23.23 
 
 		 349 aa  72.8  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.493535  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2330  hypothetical protein  22.64 
 
 		 351 aa  72  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1528  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  21.35 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  24.03 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  30.25 
 
 		 383 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  26.55 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0138  hypothetical protein  18.8 
 
 		 471 aa  63.2  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  23.21 
 
 		 355 aa  62.8  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  32.31 
 
 		 337 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  26.9 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  27.95 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3113  hypothetical protein  21.43 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  25.15 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  24.58 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  27.03 
 
 		 394 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  27.81 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0599  FemA protein  23.65 
 
 		 347 aa  54.7  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.33847  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  25 
 
 		 339 aa  53.9  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  29.05 
 
 		 340 aa  53.5  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  27.54 
 
 		 335 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  23.83 
 
 		 346 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  29.23 
 
 		 354 aa  50.4  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1138  hypothetical protein  32.73 
 
 		 324 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2853  hypothetical protein  26.02 
 
 		 348 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.957178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0922  hypothetical protein  35.16 
 
 		 307 aa  49.7  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  23.16 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  23.98 
 
 		 366 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  23.77 
 
 		 329 aa  47  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0961  methicillin resistance protein  25.71 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  21.79 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3584  hypothetical protein  23.5 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3651  hypothetical protein  25.73 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0885  Methicillin resistance protein  22.16 
 
 		 357 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  22.92 
 
 		 366 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  22.41 
 
 		 360 aa  42.7  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>