32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1113 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1113  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  701    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  24.17 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2313  hypothetical protein  20.43 
 
 
342 aa  82.4  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1831  hypothetical protein  25.31 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0468  hypothetical protein  23.97 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2314  hypothetical protein  23.61 
 
 
338 aa  77.8  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2312  hypothetical protein  27.62 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3432  hypothetical protein  21.02 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3173  hypothetical protein  20.37 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.298047 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1337  hypothetical protein  21.56 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  24.39 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1327  hypothetical protein  23.03 
 
 
347 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0362501 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3044  hypothetical protein  22.12 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2500  hypothetical protein  20.96 
 
 
350 aa  63.2  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3442  hypothetical protein  23.28 
 
 
338 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.768278  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2763  hypothetical protein  23.29 
 
 
324 aa  51.2  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  23.08 
 
 
347 aa  50.4  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3113  hypothetical protein  20.55 
 
 
345 aa  49.7  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0767  hypothetical protein  20.83 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  23.53 
 
 
348 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  21.84 
 
 
350 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5112  hypothetical protein  20.68 
 
 
336 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0964659  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  20.77 
 
 
356 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  23.79 
 
 
380 aa  47.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1880  hypothetical protein  22.17 
 
 
309 aa  47  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  21.97 
 
 
342 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4876  hypothetical protein  23.47 
 
 
407 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239884  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  21.63 
 
 
346 aa  44.3  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  23.83 
 
 
343 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2404  hypothetical protein  23.2 
 
 
344 aa  44.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  22.54 
 
 
355 aa  43.9  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  24.82 
 
 
348 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>