43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0589 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  705    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  49.85 
 
 		 361 aa  353  2e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  50.3 
 
 		 352 aa  342  7e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  51.05 
 
 		 350 aa  339  5e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  51.83 
 
 		 343 aa  338  8e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  48.52 
 
 		 356 aa  333  2e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0288  hypothetical protein  48.22 
 
 		 354 aa  327  3e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  49.26 
 
 		 353 aa  321  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0665  hypothetical protein  49.7 
 
 		 345 aa  320  3e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0449506  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2404  hypothetical protein  46.22 
 
 		 344 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  45.16 
 
 		 346 aa  285  7e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3113  hypothetical protein  45.19 
 
 		 345 aa  271  9e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4037  hypothetical protein  42.18 
 
 		 349 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.493535  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2330  hypothetical protein  42.01 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1528  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1922  hypothetical protein  40.12 
 
 		 355 aa  229  4e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.26263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  31.96 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  32.12 
 
 		 344 aa  196  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  32.12 
 
 		 344 aa  189  5.999999999999999e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  29.94 
 
 		 344 aa  185  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  33.04 
 
 		 348 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  32.05 
 
 		 368 aa  182  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  32.34 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  31.55 
 
 		 342 aa  169  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0138  hypothetical protein  26.46 
 
 		 471 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  30.5 
 
 		 349 aa  156  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01304  hypothetical protein  21.69 
 
 		 357 aa  103  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  23.19 
 
 		 355 aa  98.2  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  25.57 
 
 		 369 aa  87  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  22.9 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  23.05 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  23.19 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  23.28 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  23.99 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  23.23 
 
 		 360 aa  57  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3425  hypothetical protein  23.86 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.143139  normal  0.528642 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  18.57 
 
 		 341 aa  50.8  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1113  hypothetical protein  23.08 
 
 		 335 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  21.38 
 
 		 366 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  23.49 
 
 		 354 aa  46.2  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1831  hypothetical protein  21.4 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  21.13 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  21.26 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  19.93 
 
 		 363 aa  42.7  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>