23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1831 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1831  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  707    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2313  hypothetical protein  27.58 
 
 
342 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3442  hypothetical protein  24.76 
 
 
338 aa  133  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.768278  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2500  hypothetical protein  29.6 
 
 
350 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1337  hypothetical protein  27.49 
 
 
342 aa  127  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3173  hypothetical protein  29.51 
 
 
334 aa  119  6e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.298047 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3432  hypothetical protein  28.23 
 
 
339 aa  116  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2312  hypothetical protein  27.99 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3044  hypothetical protein  25.97 
 
 
340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2314  hypothetical protein  25.23 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5112  hypothetical protein  23.45 
 
 
336 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0964659  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  23.7 
 
 
335 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  21.99 
 
 
332 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1113  hypothetical protein  25.31 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2728  protein of unknown function DUF482  23.92 
 
 
360 aa  59.7  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1880  hypothetical protein  25 
 
 
309 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0882  hypothetical protein  21.35 
 
 
309 aa  50.4  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.92764 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  19.43 
 
 
352 aa  50.4  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0767  hypothetical protein  21.37 
 
 
308 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  21.25 
 
 
368 aa  50.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  21.23 
 
 
347 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  21.51 
 
 
346 aa  47.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  21.4 
 
 
347 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.611508 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>