19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2500 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2500  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  718    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3442  hypothetical protein  45.88 
 
 
338 aa  296  4e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.768278  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5112  hypothetical protein  41.09 
 
 
336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0964659  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3044  hypothetical protein  38.78 
 
 
340 aa  249  4e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3173  hypothetical protein  34.92 
 
 
334 aa  164  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.298047 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3432  hypothetical protein  33.12 
 
 
339 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1831  hypothetical protein  29.6 
 
 
339 aa  134  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2313  hypothetical protein  25.66 
 
 
342 aa  122  7e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2314  hypothetical protein  26.44 
 
 
338 aa  113  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1337  hypothetical protein  25.38 
 
 
342 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2312  hypothetical protein  27.99 
 
 
343 aa  104  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1113  hypothetical protein  20.96 
 
 
335 aa  63.2  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  19.82 
 
 
335 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4037  hypothetical protein  22.48 
 
 
349 aa  50.1  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.493535  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1880  hypothetical protein  27.72 
 
 
309 aa  47.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  23.81 
 
 
360 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  27.22 
 
 
354 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  35.8 
 
 
372 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  20.73 
 
 
332 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>