84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3053 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  100 
 
 
354 aa  716    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  53.24 
 
 
366 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  45.98 
 
 
354 aa  290  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  51.32 
 
 
366 aa  267  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  36.99 
 
 
347 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  31.71 
 
 
363 aa  168  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  30.81 
 
 
360 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  31.34 
 
 
370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  32.57 
 
 
346 aa  139  8.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  29.92 
 
 
366 aa  139  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  28.99 
 
 
342 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  31.5 
 
 
340 aa  126  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0771  methicillin resistance protein  25.63 
 
 
377 aa  106  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.455727  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  29.91 
 
 
337 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  31.46 
 
 
329 aa  103  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  30.66 
 
 
373 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1393  hypothetical protein  28.57 
 
 
331 aa  95.5  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0885  Methicillin resistance protein  26.19 
 
 
357 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  25.82 
 
 
343 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  23.1 
 
 
354 aa  94.4  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  29.93 
 
 
347 aa  89  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  26.58 
 
 
416 aa  86.7  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  25.45 
 
 
352 aa  86.7  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  25.4 
 
 
394 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  22.69 
 
 
341 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  26.67 
 
 
421 aa  84.3  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  25.08 
 
 
364 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  26.67 
 
 
421 aa  84.3  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  26.91 
 
 
368 aa  83.6  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  27.21 
 
 
335 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  29.95 
 
 
370 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0599  FemA protein  20.82 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.33847  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0509  beta-lactam resistance factor  25.32 
 
 
403 aa  73.2  0.000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.695705  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0961  methicillin resistance protein  25.52 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0510  murM protein, putative  24.07 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2347  FemAB family protein  24.51 
 
 
445 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.439209  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2059  FemAB family protein  24.51 
 
 
445 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  22.74 
 
 
339 aa  66.6  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  25.25 
 
 
345 aa  65.5  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1112  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  25.23 
 
 
404 aa  63.5  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  25.09 
 
 
344 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  28.17 
 
 
383 aa  60.8  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0961  hypothetical protein  24.46 
 
 
372 aa  60.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.605405  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1185  methicillin resistance protein  27.56 
 
 
315 aa  59.7  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.192582  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  21.39 
 
 
344 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  26.3 
 
 
370 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0719  hypothetical protein  22.99 
 
 
333 aa  57.8  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00617075  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  23.49 
 
 
346 aa  57.4  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  26.74 
 
 
332 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3584  hypothetical protein  25 
 
 
366 aa  56.6  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  21.99 
 
 
344 aa  56.2  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1442  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  21.28 
 
 
422 aa  54.7  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  20.25 
 
 
344 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2372  UDP-N-acetylmuramoylpentapeptide-lysine N(6)-alanyltransferase  21.45 
 
 
396 aa  54.3  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3044  hypothetical protein  28.85 
 
 
340 aa  53.9  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1027  hypothetical protein  25.79 
 
 
426 aa  53.9  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4293  hypothetical protein  24.22 
 
 
334 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0525491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0886  Methicillin resistance protein  22.22 
 
 
437 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5355  hypothetical protein  26.98 
 
 
359 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0746954 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  21.55 
 
 
368 aa  53.1  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3925  hypothetical protein  23.88 
 
 
334 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.0555776 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1922  hypothetical protein  22.84 
 
 
355 aa  52.4  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.26263  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  25.45 
 
 
348 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  21.38 
 
 
342 aa  50.8  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1029  hypothetical protein  24.38 
 
 
422 aa  50.8  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  25.54 
 
 
346 aa  50.4  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5112  hypothetical protein  28.39 
 
 
336 aa  49.3  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0964659  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4037  hypothetical protein  24.85 
 
 
349 aa  49.3  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.493535  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2928  Methicillin resistance protein  27.43 
 
 
410 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.651446 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0220  hypothetical protein  23.4 
 
 
331 aa  48.9  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.186583  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4359  hypothetical protein  22.22 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  24.2 
 
 
343 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2313  hypothetical protein  23.79 
 
 
342 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  27.32 
 
 
360 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  21.94 
 
 
352 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1028  hypothetical protein  27.73 
 
 
436 aa  47.4  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5045  hypothetical protein  25.75 
 
 
332 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.280998  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4584  hypothetical protein  26.09 
 
 
332 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.91512 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  23.49 
 
 
347 aa  46.2  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5010  femAB family protein  23.12 
 
 
341 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.342142  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  20.82 
 
 
355 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2500  hypothetical protein  27.22 
 
 
350 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01304  hypothetical protein  19.77 
 
 
357 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0487  hypothetical protein  29.19 
 
 
362 aa  43.1  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>