67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1256 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  100 
 
 
347 aa  716    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  47.85 
 
 
329 aa  299  5e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1393  hypothetical protein  44.44 
 
 
331 aa  283  4.0000000000000003e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  30.21 
 
 
363 aa  126  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  27.58 
 
 
366 aa  120  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  31.62 
 
 
347 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  28.31 
 
 
360 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  31.31 
 
 
337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  31.85 
 
 
366 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  27.05 
 
 
370 aa  110  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  28.9 
 
 
346 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  31.94 
 
 
354 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  33.09 
 
 
366 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  26.73 
 
 
340 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  24.29 
 
 
354 aa  91.7  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  28.48 
 
 
354 aa  90.9  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  28.42 
 
 
341 aa  87.8  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  24.84 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  27.95 
 
 
342 aa  82.8  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  30.84 
 
 
421 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  30.84 
 
 
421 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0771  methicillin resistance protein  24.93 
 
 
377 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.455727  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  26.32 
 
 
368 aa  77.8  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0885  Methicillin resistance protein  27.78 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  28.5 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  28.36 
 
 
416 aa  73.6  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0961  hypothetical protein  26.86 
 
 
372 aa  73.2  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.605405  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0961  methicillin resistance protein  27.55 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  26.8 
 
 
383 aa  70.5  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  25.44 
 
 
370 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3584  hypothetical protein  25.17 
 
 
366 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  26.26 
 
 
352 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  27.78 
 
 
364 aa  64.3  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0220  hypothetical protein  23.66 
 
 
331 aa  61.6  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.186583  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0599  FemA protein  25.68 
 
 
347 aa  58.2  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.33847  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  25.68 
 
 
394 aa  56.2  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1185  methicillin resistance protein  26.09 
 
 
315 aa  56.2  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.192582  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  21.75 
 
 
355 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1029  hypothetical protein  27.23 
 
 
422 aa  53.9  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0509  beta-lactam resistance factor  26.76 
 
 
403 aa  52.8  0.000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.695705  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  21.92 
 
 
345 aa  52.4  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2330  hypothetical protein  21.66 
 
 
351 aa  51.2  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1528  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0190  hypothetical protein  21.43 
 
 
379 aa  50.4  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1112  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  31.58 
 
 
404 aa  50.4  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3044  hypothetical protein  27.54 
 
 
340 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0947  femB protein  20.65 
 
 
417 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.453149  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2928  Methicillin resistance protein  30.11 
 
 
410 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.651446 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4293  hypothetical protein  24.07 
 
 
334 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0525491 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  25.31 
 
 
335 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3925  hypothetical protein  23.73 
 
 
334 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.0555776 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1831  hypothetical protein  21.23 
 
 
339 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1465  methicillin resistance protein  20.33 
 
 
419 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.109752  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1436  methicillin resistance protein  20.33 
 
 
419 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.250722  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  24.38 
 
 
346 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1922  hypothetical protein  22.97 
 
 
355 aa  47  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.26263  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  21.28 
 
 
339 aa  47  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  25.25 
 
 
346 aa  46.6  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  22.86 
 
 
753 aa  46.2  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1028  hypothetical protein  24.1 
 
 
436 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1435  methicillin resistance protein  24.19 
 
 
420 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.452442  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1464  methicillin resistance protein  24.19 
 
 
420 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.297112  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3308  hypothetical protein  23.7 
 
 
353 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  23.12 
 
 
332 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  24.12 
 
 
380 aa  43.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5355  hypothetical protein  24.76 
 
 
359 aa  43.1  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0746954 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2312  hypothetical protein  22.3 
 
 
343 aa  42.7  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  21.54 
 
 
344 aa  42.7  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>