53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1112 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1112  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  100 
 
 		 404 aa  829    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0509  beta-lactam resistance factor  53.13 
 
 		 403 aa  423  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.695705  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0510  murM protein, putative  41.91 
 
 		 406 aa  329  5.0000000000000004e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2372  UDP-N-acetylmuramoylpentapeptide-lysine N(6)-alanyltransferase  34.78 
 
 		 396 aa  249  4e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  28.36 
 
 		 416 aa  142  9e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  28.43 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  28.43 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0947  femB protein  27.27 
 
 		 417 aa  122  9e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.453149  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0886  Methicillin resistance protein  24.87 
 
 		 437 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1465  methicillin resistance protein  26.82 
 
 		 419 aa  116  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.109752  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1436  methicillin resistance protein  26.82 
 
 		 419 aa  116  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.250722  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2347  FemAB family protein  27.42 
 
 		 445 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.439209  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2059  FemAB family protein  27.42 
 
 		 445 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2001  fmhA protein  26.36 
 
 		 415 aa  110  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0327  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  24.11 
 
 		 417 aa  108  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.297856  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1029  hypothetical protein  23.81 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1464  methicillin resistance protein  24.17 
 
 		 420 aa  106  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.297112  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1435  methicillin resistance protein  24.17 
 
 		 420 aa  106  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.452442  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  24.56 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2484  methicillin resistance protein  24.61 
 
 		 416 aa  99.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2436  methicillin resistance protein  24.61 
 
 		 416 aa  99.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0946  femA protein  23.86 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.70677  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1442  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  24.94 
 
 		 422 aa  92.8  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  22.54 
 
 		 360 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1028  hypothetical protein  23.93 
 
 		 436 aa  89  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1307  methicillin resistance protein  22.79 
 
 		 414 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1332  methicillin resistance protein  22.79 
 
 		 414 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0318895  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  22.99 
 
 		 341 aa  87.4  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0386  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  27.3 
 
 		 381 aa  87  5e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1027  hypothetical protein  24.9 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1349  beta-lactam resistance factor  24.81 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.620165  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  27.44 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  24.59 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  26.34 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  23.06 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  26.92 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  26.21 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0508  beta-lactam resistance factor  22.36 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0830649  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  25.23 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  22.5 
 
 		 370 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  27.75 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  25.09 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  21.34 
 
 		 329 aa  57  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  24.9 
 
 		 337 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  25.35 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  23.81 
 
 		 345 aa  54.7  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  19.11 
 
 		 383 aa  53.9  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0644  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  22.19 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0882  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  18.37 
 
 		 388 aa  52.8  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  23.01 
 
 		 339 aa  52  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  31.58 
 
 		 347 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  22.98 
 
 		 366 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  21.23 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>