67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0801 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  100 
 
 
373 aa  781    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0961  methicillin resistance protein  38.02 
 
 
359 aa  266  4e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  38.78 
 
 
364 aa  258  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2928  Methicillin resistance protein  35.9 
 
 
410 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.651446 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  37.78 
 
 
352 aa  250  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0599  FemA protein  29.67 
 
 
347 aa  150  3e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.33847  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  38.97 
 
 
342 aa  142  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  36.65 
 
 
360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  39.57 
 
 
366 aa  133  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  38.5 
 
 
363 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  36.14 
 
 
370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  35.59 
 
 
343 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  29.59 
 
 
347 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  29.1 
 
 
370 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  35.47 
 
 
394 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  32.82 
 
 
366 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  30.3 
 
 
366 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  31.28 
 
 
337 aa  97.4  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  30.66 
 
 
354 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  27.13 
 
 
383 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  35.03 
 
 
340 aa  89.7  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  29.02 
 
 
354 aa  87.8  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0771  methicillin resistance protein  27.86 
 
 
377 aa  87  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.455727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  27.14 
 
 
354 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  29.8 
 
 
341 aa  83.6  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0885  Methicillin resistance protein  26 
 
 
357 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1185  methicillin resistance protein  30.05 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.192582  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  38.32 
 
 
416 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  28.64 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  29.47 
 
 
346 aa  77  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2059  FemAB family protein  39.36 
 
 
445 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2347  FemAB family protein  39.36 
 
 
445 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.439209  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  36.75 
 
 
421 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  36.75 
 
 
421 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  23.12 
 
 
329 aa  67.8  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0961  hypothetical protein  28.09 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.605405  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  25.39 
 
 
368 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  25.66 
 
 
345 aa  58.2  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1464  methicillin resistance protein  28 
 
 
420 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.297112  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1435  methicillin resistance protein  28 
 
 
420 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.452442  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2001  fmhA protein  22.94 
 
 
415 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0946  femA protein  27.37 
 
 
417 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.70677  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  23.91 
 
 
335 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  23.39 
 
 
346 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0190  hypothetical protein  26.58 
 
 
379 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2436  methicillin resistance protein  22.08 
 
 
416 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2484  methicillin resistance protein  22.08 
 
 
416 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1332  methicillin resistance protein  23.14 
 
 
414 aa  50.4  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0318895  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1307  methicillin resistance protein  23.14 
 
 
414 aa  50.4  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  24.92 
 
 
339 aa  50.4  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3584  hypothetical protein  25.28 
 
 
366 aa  49.7  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0947  femB protein  27.1 
 
 
417 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.453149  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1791  hypothetical protein  32.08 
 
 
305 aa  48.5  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.344205 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0386  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  30.85 
 
 
381 aa  48.1  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3349  hypothetical protein  25.29 
 
 
364 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1393  hypothetical protein  23.23 
 
 
331 aa  45.8  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1027  hypothetical protein  29.09 
 
 
426 aa  44.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0882  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  27 
 
 
388 aa  45.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1112  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  21.23 
 
 
404 aa  45.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1029  hypothetical protein  21.87 
 
 
422 aa  45.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  32.58 
 
 
332 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  23.96 
 
 
344 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  26.14 
 
 
368 aa  43.5  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  23.56 
 
 
344 aa  43.1  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1465  methicillin resistance protein  25.88 
 
 
419 aa  43.1  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.109752  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1436  methicillin resistance protein  25.88 
 
 
419 aa  43.1  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.250722  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0922  hypothetical protein  24.48 
 
 
307 aa  42.7  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>