82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5796 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  100 
 
 		 370 aa  757    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  63.17 
 
 		 383 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  50.13 
 
 		 394 aa  360  3e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  32.35 
 
 		 360 aa  153  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  29.65 
 
 		 363 aa  139  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  29.23 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  29.56 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  35.87 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  29.1 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  29.57 
 
 		 364 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0599  FemA protein  23.68 
 
 		 347 aa  100  3e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.33847  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0961  methicillin resistance protein  29.65 
 
 		 359 aa  96.3  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  30.43 
 
 		 354 aa  95.1  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  33.53 
 
 		 342 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2347  FemAB family protein  36.36 
 
 		 445 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.439209  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2059  FemAB family protein  36.36 
 
 		 445 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  27.15 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  26.61 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  30.54 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  25.44 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  24.75 
 
 		 354 aa  79.3  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2928  Methicillin resistance protein  26.55 
 
 		 410 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.651446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  29.95 
 
 		 354 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  21.85 
 
 		 341 aa  75.9  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  24.72 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  28.79 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  23.82 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1112  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  26.21 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0961  hypothetical protein  28.74 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.605405  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0509  beta-lactam resistance factor  24.69 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.695705  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  30.11 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  27.08 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0220  hypothetical protein  27.32 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.186583  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  21.14 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  24.48 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  24.48 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  25.44 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  24.04 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1435  methicillin resistance protein  34.12 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.452442  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1464  methicillin resistance protein  34.12 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.297112  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0771  methicillin resistance protein  23.06 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.455727  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1185  methicillin resistance protein  25.11 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.192582  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  27.95 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3584  hypothetical protein  28.81 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  29.01 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0510  murM protein, putative  34.57 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0885  Methicillin resistance protein  23.28 
 
 		 357 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  29.93 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  27.75 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0190  hypothetical protein  29.78 
 
 		 379 aa  57  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0946  femA protein  27.55 
 
 		 417 aa  57  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.70677  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  25 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  25.81 
 
 		 753 aa  54.7  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  29.63 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2372  UDP-N-acetylmuramoylpentapeptide-lysine N(6)-alanyltransferase  22.35 
 
 		 396 aa  53.5  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2484  methicillin resistance protein  28.7 
 
 		 416 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2436  methicillin resistance protein  28.7 
 
 		 416 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1791  hypothetical protein  32.48 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.344205 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0644  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  21.05 
 
 		 411 aa  51.2  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0882  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  20.05 
 
 		 388 aa  50.1  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1307  methicillin resistance protein  25.26 
 
 		 414 aa  49.7  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1332  methicillin resistance protein  25.26 
 
 		 414 aa  49.7  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0318895  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0947  femB protein  21.56 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.453149  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  26.75 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3349  hypothetical protein  24.34 
 
 		 364 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  27.11 
 
 		 344 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3044  hypothetical protein  25.31 
 
 		 340 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  27.22 
 
 		 344 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2001  fmhA protein  26.42 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  28.14 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5112  hypothetical protein  27.22 
 
 		 336 aa  47.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0964659  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  28.26 
 
 		 342 aa  47.4  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  25 
 
 		 361 aa  46.6  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1442  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  22.94 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0327  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  28.04 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.297856  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  23.28 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  26.01 
 
 		 348 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3442  hypothetical protein  25.81 
 
 		 338 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.768278  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  23.18 
 
 		 369 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0062  putative FemAB family protein  28.74 
 
 		 323 aa  43.9  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.731343 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1436  methicillin resistance protein  21.54 
 
 		 419 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.250722  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1465  methicillin resistance protein  21.54 
 
 		 419 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.109752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>