51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0961 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0961  methicillin resistance protein  100 
 
 		 359 aa  745    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  67.14 
 
 		 352 aa  502  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  67.61 
 
 		 364 aa  496  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2928  Methicillin resistance protein  58.62 
 
 		 410 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.651446 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  38.02 
 
 		 373 aa  266  4e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0599  FemA protein  26.33 
 
 		 347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.33847  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  34.26 
 
 		 360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  37.09 
 
 		 370 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  37.64 
 
 		 363 aa  119  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  37 
 
 		 343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  35.39 
 
 		 366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  33.48 
 
 		 342 aa  105  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  26.33 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  28.7 
 
 		 383 aa  97.1  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  29.65 
 
 		 370 aa  96.3  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  26.63 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2059  FemAB family protein  37.23 
 
 		 445 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2347  FemAB family protein  37.23 
 
 		 445 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.439209  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  31.84 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  26.26 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  27.55 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  25.52 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  23.36 
 
 		 354 aa  69.3  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1185  methicillin resistance protein  28.57 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.192582  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  29.47 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  28.07 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  30.05 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0885  Methicillin resistance protein  27.04 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0771  methicillin resistance protein  26.15 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.455727  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  28.26 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  31.58 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  31.58 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  24.24 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0190  hypothetical protein  27.18 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0220  hypothetical protein  22.93 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.186583  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  30.85 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3584  hypothetical protein  25.13 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  28.65 
 
 		 346 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  24.41 
 
 		 753 aa  51.6  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  27.03 
 
 		 329 aa  50.4  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0961  hypothetical protein  24.28 
 
 		 372 aa  50.4  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.605405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  26.86 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0947  femB protein  26.6 
 
 		 417 aa  47  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.453149  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1436  methicillin resistance protein  25.53 
 
 		 419 aa  47  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.250722  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1465  methicillin resistance protein  25.53 
 
 		 419 aa  47  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.109752  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  25.71 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0922  hypothetical protein  25.91 
 
 		 307 aa  44.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  26.75 
 
 		 380 aa  43.5  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3349  hypothetical protein  26.32 
 
 		 364 aa  43.1  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  22.58 
 
 		 342 aa  43.1  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  26.32 
 
 		 369 aa  42.7  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>