56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0739 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  100 
 
 		 368 aa  745    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  42.53 
 
 		 340 aa  251  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  39.77 
 
 		 346 aa  228  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  33.44 
 
 		 363 aa  147  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  31.88 
 
 		 360 aa  136  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  28.12 
 
 		 347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  27.02 
 
 		 366 aa  103  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  28.75 
 
 		 370 aa  102  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  29.55 
 
 		 354 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  28.37 
 
 		 366 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  27.33 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  31.1 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  26.91 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  26.99 
 
 		 329 aa  82.8  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  25.81 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  28.88 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  28.43 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0771  methicillin resistance protein  25.47 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.455727  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  21.81 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  25.1 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  23.71 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  24.04 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  25.39 
 
 		 373 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  22.75 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  25.82 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1393  hypothetical protein  23.12 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0885  Methicillin resistance protein  22.78 
 
 		 357 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  30.17 
 
 		 332 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  28.12 
 
 		 346 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  26.36 
 
 		 348 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  24.64 
 
 		 421 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  24.64 
 
 		 421 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  22.59 
 
 		 352 aa  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  21.02 
 
 		 345 aa  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  23.95 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1185  methicillin resistance protein  26.24 
 
 		 315 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.192582  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  20.9 
 
 		 416 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  30.51 
 
 		 335 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3044  hypothetical protein  29.45 
 
 		 340 aa  50.4  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  25.1 
 
 		 342 aa  50.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  24.09 
 
 		 356 aa  50.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5010  femAB family protein  22.22 
 
 		 341 aa  49.3  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.342142  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1138  hypothetical protein  25.77 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0062  putative FemAB family protein  25.08 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.731343 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  24.5 
 
 		 343 aa  47.8  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2928  Methicillin resistance protein  28.28 
 
 		 410 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.651446 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3349  hypothetical protein  27.54 
 
 		 364 aa  46.6  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  21.52 
 
 		 344 aa  46.2  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0220  hypothetical protein  22.67 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.186583  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5112  hypothetical protein  30.3 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0964659  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  21.47 
 
 		 364 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  25 
 
 		 370 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0961  hypothetical protein  23.66 
 
 		 372 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.605405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  23.14 
 
 		 350 aa  44.3  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  23.53 
 
 		 346 aa  43.5  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  28.5 
 
 		 360 aa  43.1  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>