55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0885 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0885  Methicillin resistance protein  100 
 
 
357 aa  747    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0771  methicillin resistance protein  60 
 
 
377 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.455727  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  30.79 
 
 
363 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  26.44 
 
 
370 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  28.74 
 
 
366 aa  133  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  28.61 
 
 
360 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  31.96 
 
 
366 aa  125  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  29.15 
 
 
366 aa  102  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  26.59 
 
 
347 aa  97.8  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  26.71 
 
 
354 aa  96.3  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  27.19 
 
 
341 aa  93.6  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  26.72 
 
 
354 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  25.87 
 
 
342 aa  86.7  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  27.11 
 
 
346 aa  86.7  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  28.44 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  26 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  27.78 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  22.47 
 
 
354 aa  77.8  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0599  FemA protein  22.69 
 
 
347 aa  75.5  0.000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.33847  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  24 
 
 
345 aa  73.6  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  26.2 
 
 
352 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  25.47 
 
 
329 aa  69.7  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  23.89 
 
 
394 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  24.62 
 
 
421 aa  67.8  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  24.62 
 
 
421 aa  67.8  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  21.28 
 
 
343 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0961  methicillin resistance protein  27.04 
 
 
359 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  23.56 
 
 
370 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  26.17 
 
 
340 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  24.63 
 
 
364 aa  62  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  25.97 
 
 
416 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  23.66 
 
 
383 aa  60.5  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  22.93 
 
 
368 aa  57.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  21.94 
 
 
346 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  24.58 
 
 
335 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2928  Methicillin resistance protein  30.56 
 
 
410 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.651446 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  22.61 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  24.16 
 
 
332 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  21.36 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4584  hypothetical protein  24.01 
 
 
332 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.91512 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1393  hypothetical protein  24.02 
 
 
331 aa  50.4  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5045  hypothetical protein  23.68 
 
 
332 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.280998  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0719  hypothetical protein  21.81 
 
 
333 aa  50.1  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00617075  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  25.77 
 
 
753 aa  49.7  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  24.69 
 
 
339 aa  48.5  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0062  putative FemAB family protein  25.11 
 
 
323 aa  47.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.731343 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2059  FemAB family protein  31.25 
 
 
445 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2347  FemAB family protein  31.25 
 
 
445 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.439209  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0220  hypothetical protein  25.71 
 
 
331 aa  46.6  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.186583  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0922  hypothetical protein  24.18 
 
 
307 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5355  hypothetical protein  24.03 
 
 
359 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0746954 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  20.43 
 
 
344 aa  44.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  22.27 
 
 
346 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  19.34 
 
 
342 aa  43.1  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  30.48 
 
 
490 aa  42.7  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>