99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3975 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  100 
 
 		 366 aa  732    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  79.83 
 
 		 366 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  53.24 
 
 		 354 aa  319  6e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  49.56 
 
 		 354 aa  312  4.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  35.67 
 
 		 363 aa  196  8.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  31.88 
 
 		 360 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  33.53 
 
 		 347 aa  176  8e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  30.99 
 
 		 366 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  28.96 
 
 		 370 aa  149  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  32.25 
 
 		 346 aa  139  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0771  methicillin resistance protein  29.94 
 
 		 377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.455727  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  30.81 
 
 		 340 aa  126  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0885  Methicillin resistance protein  32.26 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  30.37 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  31.85 
 
 		 347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  29.88 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  25.07 
 
 		 343 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1393  hypothetical protein  28.65 
 
 		 331 aa  102  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0599  FemA protein  23.12 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.33847  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  23.42 
 
 		 341 aa  100  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  32.82 
 
 		 373 aa  99.8  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  30.66 
 
 		 329 aa  99.4  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  29.2 
 
 		 368 aa  97.1  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  27.61 
 
 		 383 aa  91.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  23.13 
 
 		 354 aa  91.3  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  26.64 
 
 		 368 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  27.15 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  31.25 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  30.41 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  25.51 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  27.24 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  25.62 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  25.74 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  25.74 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  23.28 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1112  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  26.92 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0509  beta-lactam resistance factor  26.41 
 
 		 403 aa  70.1  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.695705  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  28.42 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0961  methicillin resistance protein  29.47 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  29.47 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0510  murM protein, putative  26.27 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  30.95 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  24.2 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  24.07 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0961  hypothetical protein  22.58 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.605405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2928  Methicillin resistance protein  36.94 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.651446 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  23.03 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3584  hypothetical protein  23.65 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  26.07 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2330  hypothetical protein  24.5 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1528  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  21.26 
 
 		 352 aa  59.3  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0886  Methicillin resistance protein  26.67 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  19.02 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0487  hypothetical protein  29.52 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1185  methicillin resistance protein  24.37 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.192582  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2347  FemAB family protein  24.39 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.439209  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2059  FemAB family protein  24.39 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  23.05 
 
 		 380 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  22.97 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2853  hypothetical protein  23.97 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.957178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0190  hypothetical protein  24.34 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  23.26 
 
 		 342 aa  53.9  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  25.22 
 
 		 360 aa  52.8  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  26.24 
 
 		 753 aa  52.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1922  hypothetical protein  24.3 
 
 		 355 aa  51.6  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.26263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3651  hypothetical protein  26.79 
 
 		 363 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0220  hypothetical protein  24.69 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.186583  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5355  hypothetical protein  26.61 
 
 		 359 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0746954 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4293  hypothetical protein  25.36 
 
 		 334 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0525491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3925  hypothetical protein  25 
 
 		 334 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.0555776 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0719  hypothetical protein  20.59 
 
 		 333 aa  50.1  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00617075  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  22.22 
 
 		 343 aa  49.7  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  20.55 
 
 		 355 aa  49.7  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0327  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  21.01 
 
 		 417 aa  48.9  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.297856  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  20.7 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1442  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  23.93 
 
 		 422 aa  48.1  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  21.38 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1029  hypothetical protein  26.88 
 
 		 422 aa  47.8  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  22.94 
 
 		 348 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  18.44 
 
 		 361 aa  47  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1327  hypothetical protein  26.98 
 
 		 347 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0362501 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1027  hypothetical protein  25.09 
 
 		 426 aa  45.4  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2436  methicillin resistance protein  29.57 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2484  methicillin resistance protein  29.57 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2715  hypothetical protein  28.04 
 
 		 238 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  21.68 
 
 		 348 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1028  hypothetical protein  23.87 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4037  hypothetical protein  25.15 
 
 		 349 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.493535  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4584  hypothetical protein  25.76 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.91512 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0288  hypothetical protein  23.08 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5045  hypothetical protein  25.42 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.280998  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2501  hypothetical protein  21.13 
 
 		 353 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  22.92 
 
 		 346 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1332  methicillin resistance protein  26.32 
 
 		 414 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0318895  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1307  methicillin resistance protein  26.32 
 
 		 414 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4359  hypothetical protein  23.3 
 
 		 333 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  21.88 
 
 		 353 aa  43.5  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0946  femA protein  22.03 
 
 		 417 aa  43.1  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.70677  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  20.55 
 
 		 370 aa  43.1  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>