78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0340 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  100 
 
 		 394 aa  811    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  50.13 
 
 		 383 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  50.13 
 
 		 370 aa  360  3e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  31.61 
 
 		 363 aa  169  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  31.36 
 
 		 360 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  30.79 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  28.57 
 
 		 370 aa  122  8e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  32.97 
 
 		 352 aa  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  35.47 
 
 		 373 aa  103  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  24.86 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0961  methicillin resistance protein  26.33 
 
 		 359 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  32.94 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0599  FemA protein  27.18 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.33847  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2347  FemAB family protein  39.8 
 
 		 445 aa  90.5  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.439209  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2059  FemAB family protein  39.8 
 
 		 445 aa  90.5  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  25.4 
 
 		 354 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  23.93 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  30.86 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2928  Methicillin resistance protein  24.18 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.651446 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  30.41 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  27.25 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0510  murM protein, putative  21.2 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  28.88 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  24.29 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  29.46 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3584  hypothetical protein  30.56 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  21.51 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  25.28 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  24.24 
 
 		 341 aa  72.8  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  27.39 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  27.64 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  26.12 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  29.39 
 
 		 380 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  30.54 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0190  hypothetical protein  29.14 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  24.91 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  24.91 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0961  hypothetical protein  28.33 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.605405  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0509  beta-lactam resistance factor  23.31 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.695705  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0885  Methicillin resistance protein  22.71 
 
 		 357 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1185  methicillin resistance protein  26.52 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.192582  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  25.15 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1112  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  25.09 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1791  hypothetical protein  34.19 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.344205 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  25.99 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5355  hypothetical protein  28.64 
 
 		 359 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0746954 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  27.03 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  28.25 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  31.33 
 
 		 335 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2372  UDP-N-acetylmuramoylpentapeptide-lysine N(6)-alanyltransferase  24.17 
 
 		 396 aa  54.7  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  26.85 
 
 		 346 aa  53.5  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  28.36 
 
 		 342 aa  53.5  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0220  hypothetical protein  22.16 
 
 		 331 aa  52.4  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.186583  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  26.19 
 
 		 344 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  25.9 
 
 		 344 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  26.51 
 
 		 344 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1332  methicillin resistance protein  20.18 
 
 		 414 aa  49.7  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0318895  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1307  methicillin resistance protein  20.18 
 
 		 414 aa  49.7  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0771  methicillin resistance protein  25.64 
 
 		 377 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.455727  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0947  femB protein  22.17 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.453149  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0062  putative FemAB family protein  28.09 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.731343 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1393  hypothetical protein  22.08 
 
 		 331 aa  47.8  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  26.29 
 
 		 347 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0922  hypothetical protein  28.48 
 
 		 307 aa  47.4  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0882  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  23.91 
 
 		 388 aa  47  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4359  hypothetical protein  25.54 
 
 		 333 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1465  methicillin resistance protein  21.56 
 
 		 419 aa  46.6  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.109752  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1436  methicillin resistance protein  21.56 
 
 		 419 aa  46.6  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.250722  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0946  femA protein  24.27 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.70677  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  21.43 
 
 		 370 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  27.44 
 
 		 332 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0487  hypothetical protein  32.17 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1464  methicillin resistance protein  25.3 
 
 		 420 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.297112  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1435  methicillin resistance protein  25.3 
 
 		 420 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.452442  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2001  fmhA protein  20.22 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2484  methicillin resistance protein  24.15 
 
 		 416 aa  43.9  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2436  methicillin resistance protein  24.15 
 
 		 416 aa  43.9  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3442  hypothetical protein  25.45 
 
 		 338 aa  43.5  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.768278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>