48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2928 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2928  Methicillin resistance protein  100 
 
 		 410 aa  843    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.651446 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  56.1 
 
 		 364 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0961  methicillin resistance protein  58.13 
 
 		 359 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  52.83 
 
 		 352 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  36.3 
 
 		 373 aa  252  9.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2347  FemAB family protein  22.47 
 
 		 445 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.439209  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2059  FemAB family protein  22.47 
 
 		 445 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  24.8 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  39.58 
 
 		 360 aa  87  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  38.26 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  40.62 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  24.18 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0599  FemA protein  33.9 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.33847  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  26.44 
 
 		 343 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  39.18 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  26.55 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  25.78 
 
 		 383 aa  75.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  22.62 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  22.62 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  19.77 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  34.43 
 
 		 366 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  36.94 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  29.47 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0947  femB protein  23.26 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.453149  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  35.29 
 
 		 337 aa  57  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  35.42 
 
 		 346 aa  54.7  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0885  Methicillin resistance protein  30.56 
 
 		 357 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  34.12 
 
 		 340 aa  53.9  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  35.63 
 
 		 346 aa  53.5  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0190  hypothetical protein  34.34 
 
 		 379 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0771  methicillin resistance protein  31.52 
 
 		 377 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.455727  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1465  methicillin resistance protein  23.36 
 
 		 419 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.109752  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1436  methicillin resistance protein  23.36 
 
 		 419 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.250722  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  27.27 
 
 		 354 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1185  methicillin resistance protein  24.71 
 
 		 315 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.192582  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  28.7 
 
 		 347 aa  50.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  26.02 
 
 		 354 aa  50.1  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1442  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  19.77 
 
 		 422 aa  50.1  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  30.11 
 
 		 347 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0961  hypothetical protein  29.21 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.605405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3349  hypothetical protein  26.52 
 
 		 364 aa  47  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  28.28 
 
 		 368 aa  47  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3584  hypothetical protein  30.77 
 
 		 366 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  28.28 
 
 		 341 aa  43.9  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1027  hypothetical protein  24.62 
 
 		 426 aa  43.5  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2436  methicillin resistance protein  19.61 
 
 		 416 aa  43.1  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2484  methicillin resistance protein  19.61 
 
 		 416 aa  43.1  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  27.78 
 
 		 329 aa  42.7  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>