89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0083 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  100 
 
 
354 aa  714    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  49.56 
 
 
366 aa  298  8e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  45.98 
 
 
354 aa  290  3e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  48.55 
 
 
366 aa  258  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  35.15 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  31.25 
 
 
360 aa  179  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  31.34 
 
 
363 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  27.55 
 
 
366 aa  149  9e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  28.28 
 
 
370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  32.13 
 
 
340 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  30.18 
 
 
346 aa  136  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  30.65 
 
 
342 aa  126  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0771  methicillin resistance protein  27.95 
 
 
377 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.455727  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  31.03 
 
 
347 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  29 
 
 
337 aa  104  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  21.84 
 
 
354 aa  102  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  29.55 
 
 
368 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  28.11 
 
 
329 aa  97.4  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1393  hypothetical protein  31.07 
 
 
331 aa  96.7  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  26.02 
 
 
339 aa  95.1  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  27.14 
 
 
373 aa  85.9  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0885  Methicillin resistance protein  26.51 
 
 
357 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  23.51 
 
 
343 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  23.93 
 
 
394 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0599  FemA protein  23.72 
 
 
347 aa  82  0.00000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.33847  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  27.8 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  24.75 
 
 
370 aa  79.3  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  22.22 
 
 
352 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1112  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  26.34 
 
 
404 aa  75.5  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  21.32 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0510  murM protein, putative  23.58 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  20 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  24.86 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  20.9 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  23.16 
 
 
383 aa  69.3  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0961  methicillin resistance protein  23.36 
 
 
359 aa  69.3  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2059  FemAB family protein  24.26 
 
 
445 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2347  FemAB family protein  24.26 
 
 
445 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.439209  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0961  hypothetical protein  24.53 
 
 
372 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.605405  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1185  methicillin resistance protein  25.22 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.192582  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  21.45 
 
 
341 aa  65.1  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  20.58 
 
 
421 aa  63.2  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  20.58 
 
 
421 aa  63.2  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  24.83 
 
 
332 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0509  beta-lactam resistance factor  22.27 
 
 
403 aa  61.2  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.695705  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0220  hypothetical protein  25 
 
 
331 aa  58.9  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.186583  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  23.81 
 
 
753 aa  57.8  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2404  hypothetical protein  20.12 
 
 
344 aa  57  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  20.83 
 
 
361 aa  54.3  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  23.05 
 
 
343 aa  54.3  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  21.98 
 
 
370 aa  53.1  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5355  hypothetical protein  24.43 
 
 
359 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0746954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3651  hypothetical protein  27.07 
 
 
363 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0487  hypothetical protein  29.92 
 
 
362 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  22.03 
 
 
346 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1435  methicillin resistance protein  28.57 
 
 
420 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.452442  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1464  methicillin resistance protein  28.57 
 
 
420 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.297112  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  24.2 
 
 
368 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2928  Methicillin resistance protein  27.27 
 
 
410 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.651446 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0946  femA protein  27.83 
 
 
417 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.70677  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  22.22 
 
 
356 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  21.93 
 
 
380 aa  50.4  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2330  hypothetical protein  23.71 
 
 
351 aa  50.4  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1528  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  21.65 
 
 
344 aa  50.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  21.39 
 
 
353 aa  49.7  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  26.92 
 
 
369 aa  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  23.2 
 
 
416 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0288  hypothetical protein  21.93 
 
 
354 aa  48.9  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  20.21 
 
 
349 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3417  putative FemAB family protein  27.27 
 
 
328 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.658974  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  21.93 
 
 
352 aa  47  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4037  hypothetical protein  23.98 
 
 
349 aa  47  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.493535  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01304  hypothetical protein  18.82 
 
 
357 aa  46.6  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  21.76 
 
 
342 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  20.97 
 
 
350 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4359  hypothetical protein  23.43 
 
 
333 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2001  fmhA protein  26.71 
 
 
415 aa  44.3  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1436  methicillin resistance protein  23.2 
 
 
419 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.250722  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1465  methicillin resistance protein  23.2 
 
 
419 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.109752  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3584  hypothetical protein  23.68 
 
 
366 aa  43.9  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0190  hypothetical protein  23.62 
 
 
379 aa  43.5  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0947  femB protein  23.28 
 
 
417 aa  43.5  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.453149  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  18.82 
 
 
355 aa  43.5  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3925  hypothetical protein  23.58 
 
 
334 aa  43.5  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.0555776 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4293  hypothetical protein  23.3 
 
 
334 aa  43.5  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0525491 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0665  hypothetical protein  23.81 
 
 
345 aa  43.1  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0449506  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0386  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  22.22 
 
 
381 aa  43.1  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0886  Methicillin resistance protein  26.11 
 
 
437 aa  42.7  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  20.97 
 
 
346 aa  42.7  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>